900 matches
-
genele supresoare de tumori, alterându-le funcția normală și predispune la apariția de modificări ale activității genice prin inactivarea genelor ce participă prin produșii lor în procesele de reparare a leziunilor din ADN, fără a modifica structura acestora (secvența de nucleotide). Studiile de epigenetică au adus clarificări asupra rolului remodelării cromatinei și reglajului genetic în tumorigeneză (Jones și Laird, 1999) și au oferit noi direcții de abordare a strategiilor terapeutice în maladia canceroasă. Există dovezi asupra rolului important deținut de activitățile
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
ar putea aduce noi informații asupra mecanismelor moleculare implicate în etiologia diferitelor maladii. Obiectivele a numeroase studii se axează pe investigarea modificărilor epigenomice implicate în alterarea expresiei genice, fără a fi însoțită de mutații respectiv de schimbări în secvența de nucleotide a ADN. În ultimii ani au fost descoperite noi mecanisme implicate în reglarea expresiei genice. Aceste mecanisme se bazează pe interacția pe bază de complementaritate dintre ARN-uri de dimensiuni mici (siRNA - small interference RNA, cu lungimi cuprinse între 20-30
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
a ADN. În ultimii ani au fost descoperite noi mecanisme implicate în reglarea expresiei genice. Aceste mecanisme se bazează pe interacția pe bază de complementaritate dintre ARN-uri de dimensiuni mici (siRNA - small interference RNA, cu lungimi cuprinse între 20-30 nucleotide) cu ARNm sau transcripte nascente prezente chiar în structura cromatinei. Recunoașterea și legarea pe bază de complementaritate a acestor două tipuri de molecule au drept consecință suprimarea expresiei postranscriptionale a genei, deci a translației. Interacția dintre siARN și transcriptele nascente
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
recunoscute în mod specific de către endonucleaze de restricție, generând RFLP particulare, cu valoare de diagnostic al oncogenelor în ADN din diferite tumori umane. Prin analiza RFLP s-a putut decela, în cele mai multe tumori testate, un fragment de 280 perechi de nucleotide, desemnat MnIIDNA din secvența genei mutante H-ras 1. Alături de acest fragment polimorfic se află în ADN tumoral și fragmentul normal MnIIDNA de 206 perechi de nucleotide, dovedindu-se astfel că locusul genic care adăpostește o astfel de secvență de nucleotide
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
s-a putut decela, în cele mai multe tumori testate, un fragment de 280 perechi de nucleotide, desemnat MnIIDNA din secvența genei mutante H-ras 1. Alături de acest fragment polimorfic se află în ADN tumoral și fragmentul normal MnIIDNA de 206 perechi de nucleotide, dovedindu-se astfel că locusul genic care adăpostește o astfel de secvență de nucleotide prezintă heterozigoție pentru situsul de restricție MnII. Cercetările lui Weinberg și Ruley (1983) au dovedit că oncogenele singulare precum ras și myc nu induc transformarea celulară
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
nucleotide, desemnat MnIIDNA din secvența genei mutante H-ras 1. Alături de acest fragment polimorfic se află în ADN tumoral și fragmentul normal MnIIDNA de 206 perechi de nucleotide, dovedindu-se astfel că locusul genic care adăpostește o astfel de secvență de nucleotide prezintă heterozigoție pentru situsul de restricție MnII. Cercetările lui Weinberg și Ruley (1983) au dovedit că oncogenele singulare precum ras și myc nu induc transformarea celulară, dar mutațiile apărute concomitent sau decalat în cel puțin două oncogene induc procesul de
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
care are un rol esențial în inducerea apoptozei (Lee și colab., 2004). Proteina BAK - de la Bcl-2 homologous antagonist killer Gena Bak este localizată 6p21.31 și are în componența sa șase exoni și o lungime de aproximativ 2200 perechi de nucleotide. Proteina BAK are o greutate moleculară de aproximativ 23 400 Daltoni și este alcătuită din 211 aminoacizi. Ea este localizată pe fața internă a membranei mitocondriale, unde este menținută în stare inactivă prin heterodimerizare cu MCL1 (membru antiapoptotic al familiei
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
corespunzătoare celor trei domenii esențiale pentru funcțiile proteinei APAF1. Varianta Apaf1-S este considerată forma sălbatică. Ea are o lungime de 3585 bp și conține 12 repetiții WD40. Varianta Apaf1-M are o lungime de 3618 bp (prezintă o inserție de 33 nucleotide după poziția 295) și conține 12 repetiții WD40; varianta Apaf1-XS are 3516 bp, și conține o inserție de 24 nucleotide începând cu poziția 1725, inserție identificată și la Apaf1-M, dar nu conține secvența cuprinsă între pozițiile 3171 și 3296 descrise
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
3585 bp și conține 12 repetiții WD40. Varianta Apaf1-M are o lungime de 3618 bp (prezintă o inserție de 33 nucleotide după poziția 295) și conține 12 repetiții WD40; varianta Apaf1-XS are 3516 bp, și conține o inserție de 24 nucleotide începând cu poziția 1725, inserție identificată și la Apaf1-M, dar nu conține secvența cuprinsă între pozițiile 3171 și 3296 descrise la varianta Apaf1-S care este corespondentul domeniului WD40; varianta Apaf1-L are o lungime de 3714 bp, conține o inserție de
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
cu poziția 1725, inserție identificată și la Apaf1-M, dar nu conține secvența cuprinsă între pozițiile 3171 și 3296 descrise la varianta Apaf1-S care este corespondentul domeniului WD40; varianta Apaf1-L are o lungime de 3714 bp, conține o inserție de 129 nucleotide începând cu poziția 2466 și 13 repetiții WD40; varianta Apaf1-XL are o lungime de 3747 bp, conține o inserție de 129 bp, inserția descrisă la Apaf1-M și 13 repetiții WD40. Proteina APAF-1 este structurată pe mai multe domenii: domeniul CARD
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
are o lungime de 3747 bp, conține o inserție de 129 bp, inserția descrisă la Apaf1-M și 13 repetiții WD40. Proteina APAF-1 este structurată pe mai multe domenii: domeniul CARD localizat N-terminal, trei domenii alfa/beta de atașare a nucleotidelor, domeniul helical I, domeniul de culisare și domeniul helical II. La capătul C-terminal se regăsesc 12-13 repetiții WD40. Analiza structurii proteinei APAF-1 sugerează că atașarea nucleotidelor induce modificări conformaționale ale acesteia care vor determina apariția unei structuri permisive pentru
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
domenii: domeniul CARD localizat N-terminal, trei domenii alfa/beta de atașare a nucleotidelor, domeniul helical I, domeniul de culisare și domeniul helical II. La capătul C-terminal se regăsesc 12-13 repetiții WD40. Analiza structurii proteinei APAF-1 sugerează că atașarea nucleotidelor induce modificări conformaționale ale acesteia care vor determina apariția unei structuri permisive pentru formarea apoptozomului activator al caspazei 9 în care APAF1 reprezintă regiunea centrală. Activarea căii mitocondriale determină eliberarea citocromului c care induce modificarea conformației Apaf-1 prin atașarea de
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
catalitic dar nu are secvență codificatoare dată de exonii trei-șase, putându-se atașa la APAF-1, împiedicând atașarea variantei normale și casp-9 gamma, care rezultă în urma splicing-ului alternativ al exonului patru al caspazei-9 normale și care are o inserție de 58 nucleotide. Segmentul inserat în casp-9 gamma introduce un codon stop prematur care determină apariția unei proteine de 154 aminoacizi corespunzătoare domeniului CARD al CASP-9 normale. CASP 9gamma nu conține subunitățile catalitice și nu poate promova apoptoza, dar asemănător caspazei beta poate
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
a sa este cuprinsă între pozițiile 210 și 305 (Huang și colab., 1996). Regiunea lui FAS din 15 resturi carboxi-terminale (305-319) are rol reglator negativ în apoptoză. În limfomul nazal, s-a identificat o regiune deletată de 23 perechi de nucleotide din gena Fas care este localizată între nucleotidele 496-513 (Shen și colab., 2002). Pre-ARNm Fas va genera, prin splicing alternativ, opt variante de ARNm care sunt traduse în șapte tipuri de proteine. Receptorul FAS care induce apoptoza este isoforma-1, o
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
305 (Huang și colab., 1996). Regiunea lui FAS din 15 resturi carboxi-terminale (305-319) are rol reglator negativ în apoptoză. În limfomul nazal, s-a identificat o regiune deletată de 23 perechi de nucleotide din gena Fas care este localizată între nucleotidele 496-513 (Shen și colab., 2002). Pre-ARNm Fas va genera, prin splicing alternativ, opt variante de ARNm care sunt traduse în șapte tipuri de proteine. Receptorul FAS care induce apoptoza este isoforma-1, o proteină transmembranară de tipul I. Structura tridimensională a
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
translocarea sa în citoplasmă; g) Caspaza-8 clivează procaspaza-3 în caspază-3 activă; h) Caspaza-3 scindează I-CAD, care astfel nu mai poate inhiba activitatea lui CAD; i) CAD pătrunde în nucleu și clivează ADN în fragmente de câte 180 perechi de nucleotide. Această cascadă proteolitică mediată de caspaze este punctul central al procesului apoptotic. CD 95 joacă un rol fundamental mai ales în apoptoză pentru trei tipuri de celule: deleția periferică a celulelor T mature la sfârșitul unui răspuns imun; distrugerea unor
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
prezența unui domeniu - CARD (de la CAspase-Recruitment Domain), a unui motiv RING Zn finger și a unor domenii adiționale (ubiquitin conjugation și P loop) (Deveraux, 1999). Domeniul BIR este important pentru inhibiția caspazelor, iar motivul P loop este necesar pentru legarea nucleotidelor. Aceste elemente structurale sunt prezente în diferite combinații în structura proteinelor IAP, conferindu-le diversitate structurală și funcțională. În funcție de omologia domeniilor BIR și de prezența sau absența domeniului RING finger, aceste proteine au fost grupate în trei clase (fig. 30
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
și 9, iar ILP2 doar caspaza 9 (Richter și colab., 2001). Imunogenetică și Oncogenetică 483 Clasa 2. Unicul membru al acestei clase este proteina NAIP care se caracterizează prin prezența a trei domenii BIR și a unui domeniu NOD/NBS (Nucleotide Binding Oligomerization Domain), localizat în regiunea centrală, și o regiune carboxi-terminală bogată în leucine, desemnată LRR. Prezența ultimelor două domenii conferă identitate proteinei NAIP în cadrul familiei IAP și sugerează faptul că activitatea sa este reglată într-o manieră diferită de
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
domeniu de potențial interes, în cadrul acestei familii, este prezența unei secvențe P-loop conservată, descrisă pentru proteina NAIP. Din acest punct de vedere, proteina NAIP se aseamănă cu unele proteine care leagă ATP/GTP, însă nu s-a demonstrat dacă legarea nucleotidelor sau prezența în sine a acestei secvențe este necesară pentru supresia apoptozei. Organizarea structurală a proteinelor BIRC sugerează că unitatea structurală comună - domeniul BIR - poate fi combinat cu o varietate de alte motive, care, fie diversifică funcția, fie furnizează mecanisme
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
expresia antigenei HBs într-un vector viral, cum ar fi vaccinia sau adenovirusul (Moss și colab., 1984; Lubeck și colab., 1989), dar eficiența acestora este redusă și produc efecte secundare. Vaccinurile peptidice, constând din peptide sintetice prezise din secvența de nucleotide a genelor proteinelor structurale virale (domeniile S sau pre-S ale genei proteinei învelișului HBV) au indus protecție parțială sau completă față de infecția experimentală a maimuțelor. In general, eficiența vaccinurilor peptidice este redusă, datorită imunogenității reduse a peptidelor sintetice. Epitopii recunoscuți
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
strategii terapeutice vor fi condiționate de extinderea analizei moleculare din domeniul genomicii, proteomicii și metabolomicii țesuturilor tumorale. 32.3. UTILIZAREA INHIBITORILOR TELOMERAZEI ÎN TERAPIA CANCERULUI În condiții normale, celulele embrionare au cromozomi care prezintă la capete (telomere) secvențe repetate de nucleotide numite repetiții telomerice. Acestea sunt adăugate prin activitatea unei enzime speciale, numită telomerază - o reverstranscriptază celulară cu o structură complexă, alcătuită dintr-o parte proteinică ce efectuează activitate de polimerizare de deoxiribonucleotide și o parte prostetică reprezentată de un segment
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
transcripția unor vectori potriviți. Transcriptele ARN sunt astfel proiectate încât să se plieze pe ele însele spre a forma sectoare dublucatenare prin împerecheri intracatenare, generând structuri în buclă (agrafă) de tip hairpin cu o tulpină dublu-catenară de 19-29 perechi de nucleotide, care se potrivește țintei, și o buclă monocatenară de șase-nouă ribonucleotide. În prezent, iARN reprezintă o excelentă unealtă de laborator prin care sunt abolite diferite exprimări genice în fenotipul plantelor și animalelor de experiență, dar sunt speranțe că asemenea „manevre
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
și colab., 1998). Prin acțiunea cooperantă a proteinelor Vir D1 și Vir D2 este sintetizat un fragment monocatenar de ADN (catena T) de pe una sau mai multe regiuni ale plasmidului inductor tumoral (Ti) delimitate de secvențe specifice repetate de 25 nucleotide. Vir D2 rămâne legat covalent la capătul 5’ al catenei T care este ulterior înfășurat de proteina Vir E2 de legare la ADN monocatenar, deși nu este clar dacă această proteină se asociază cu monocatena T în celula bacteriană sau
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
transgenice rezultate și-au păstrat susceptibilitatea la transformarea indusă de Agrobacterium dar, în unele cazuri, au fost înalt refractare la tumorigeneză. Constructul autocomplementar ipt a fost creat prin fuzionarea unei copii sens a ipt - 20W - 5A pentru 45-627 perechi de nucleotide cu un fragment identic cu orientare antisens. Cele două fragmente ipt complementare au fost separate de o regiune de ADN linker necodificator de 1000 perechi de nucleotide derivat dintr-un vector de clonare. Constructul autocomplementar iaaM a fost realizat prin
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
prin fuzionarea unei copii sens a ipt - 20W - 5A pentru 45-627 perechi de nucleotide cu un fragment identic cu orientare antisens. Cele două fragmente ipt complementare au fost separate de o regiune de ADN linker necodificator de 1000 perechi de nucleotide derivat dintr-un vector de clonare. Constructul autocomplementar iaaM a fost realizat prin fuzionarea unei copii antisens a lui iaaM - 20W - 5A de 1 274-2 224 perechi de nucleotide la capătul 5’ al unui fragment sens iaaM - 20W - 5A de
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]