828 matches
-
structura poroasă a peretelui celular. Este posibil ca în perete să fie aplatizate covalent fragmentele libere din lamelele ligninei, care pot trece în soluție prin spațiile interlamelare. Datorită faptului că lanțurile sunt flexibile, aceste fragmente lamelare se pliază adoptând o conformație de sferă. O astfel de conformație poate fi așteptată mai degrabă de la o spirală compactă decât de la una statistică. În sprijinul acestei teorii s-a arătat că macromoleculele de lignină, întinse pe o suprafață insolubilă sau pe o grilă acoperită
LIGNINA – POLIMER NATURAL AROMATIC CU RIDICAT POTENȚIAL DE VALORIFICARE by ELENA UNGUREANU () [Corola-publishinghouse/Science/1630_a_2976]
-
posibil ca în perete să fie aplatizate covalent fragmentele libere din lamelele ligninei, care pot trece în soluție prin spațiile interlamelare. Datorită faptului că lanțurile sunt flexibile, aceste fragmente lamelare se pliază adoptând o conformație de sferă. O astfel de conformație poate fi așteptată mai degrabă de la o spirală compactă decât de la una statistică. În sprijinul acestei teorii s-a arătat că macromoleculele de lignină, întinse pe o suprafață insolubilă sau pe o grilă acoperită cu cărbune pentru microscopie electronică, adoptă
LIGNINA – POLIMER NATURAL AROMATIC CU RIDICAT POTENȚIAL DE VALORIFICARE by ELENA UNGUREANU () [Corola-publishinghouse/Science/1630_a_2976]
-
fi așteptată mai degrabă de la o spirală compactă decât de la una statistică. În sprijinul acestei teorii s-a arătat că macromoleculele de lignină, întinse pe o suprafață insolubilă sau pe o grilă acoperită cu cărbune pentru microscopie electronică, adoptă o conformație plată cu o grosime de aproximativ 2 nm. Se pare că structura conformațională a macromoleculei devenită solubilă reflectă ultrastructura peretelui celular din care provine. Acest concept nu se poate aplica și pentru lignina din lamela mediană, unde structura lamelară are
LIGNINA – POLIMER NATURAL AROMATIC CU RIDICAT POTENȚIAL DE VALORIFICARE by ELENA UNGUREANU () [Corola-publishinghouse/Science/1630_a_2976]
-
preliminare de dializă, concentrare sau diluare; metoda are o acuratețe de ± 10 %; pot să apară erori în modul de lucru; aparatura folosită este scumpă. Cu toate aceste dezavantaje, aplicațiile metodei sunt multiple, amintim doar determinarea structurii proteinelor, hemoproteinelor, sterolilor, determinarea conformației, purității optice, controlul reacțiilor chimice și al preparatelor farmaceutice. APLICAȚIILE DICROISMULUI CIRCULAR Determinarea structurii secundare și terțiare a proteinelor Dicroismul circular se alătură metodelor RMN și spectrometriei cu raze X, spectrometriei Raman și spectrometriei de fluorescență pentru elucidarea structurilor secundare
ANALIZA MEDICAMENTELOR VOLUMUL 1 by MIHAI IOAN LAZ?R, DOINA LAZ?R, ANDREIA CORCIOV? () [Corola-publishinghouse/Science/84343_a_85668]
-
a indicat ceva...Ar fi înspăimântător să crezi că din tot acest cosmos atât de armonios, desăvârșit și egal cu sine, numai viața omului se petrece la întâmplare, numai destinul lui nu are nici un sens"6. Camuflarea sub detalii (vestimentație, conformația mâinii: "Nici mână n-avea pentru o femeie pe care o cheamă Ileana"7) potrivite altor nume/ naturi umane amintește de dialogul platonician în care Cratylos explică nepotrivirea numelui cu natura umană ca simplă funcție de identificare în planul social. Felul
[Corola-publishinghouse/Science/84970_a_85755]
-
mare, ca și evitarea stress-ului mecanic ce poate duce la fragmentarea ADN-ului genomic în cursul purificării. Detecția și identificarea unor secvențe specifice de acid nucleic constituie o procedură de rutină în biologia moleculară. SSCP - single strand conformational polymorphism (polimorfismul conformației catenelor unice) CDGE - constant denaturing gel electrophoresis (electroforeza în gel cu denaturare constantă) Prin metoda Southern blot, ADN-ul care conține secvența țintă este digerat cu una sau mai multe enzime de restricție, după care fragmentele sunt separate în funcție de mărime
CANCERUL GLANDEI MAMARE BIOLOGIE MOLECULARĂ ŞI MARKERITUMORALI Volumul 2 by Emil ANTON, Nicolae IOANID () [Corola-publishinghouse/Science/422_a_768]
-
au capacitatea de a-și crea o copie ADN a genomului lor (ARN), necesară perioadei în care se află în celulele eucariote. PCR poate fi utilizată și pentru detectarea mutațiilor punctiforme ale unei gene, direct sau indirect, prin studiul polimorfismului conformației catenelor unice de ADN (single strand conformational polymorphism - SSCP). Transferul proteinelor (Western blotting) a fost introdus inițial pentru a identifica antigenele proteice care leagă anticorpi specifici. Un amestec complex de proteine este separat prin electroforeză, după care proteinele sunt transferate
CANCERUL GLANDEI MAMARE BIOLOGIE MOLECULARĂ ŞI MARKERITUMORALI Volumul 2 by Emil ANTON, Nicolae IOANID () [Corola-publishinghouse/Science/422_a_768]
-
omoloage, cu secvențe P-box identice și, astfel, Erα și Erβ leagă diferite elemente ale răspunsului estrogenic, cu specificitate și afinitate similare [127]. AF 2 are rol în transcripția ligand-dependentă a receptorilor nucleari [88,134,202,279]. Liganzi diferiți induc conformații diferite ale receptorilor [49,340,351], acestea afectând eficacitatea sau potențialul ligandului. O altă diferență apare la nivelul situsului AP 1. În cazul Erα, agoniști tipici precum E2, ca și antiestrogenii (Tamoxifen) au aceeași eficacitate prin intermediul AP 1. În cazul
CANCERUL GLANDEI MAMARE BIOLOGIE MOLECULARĂ ŞI MARKERITUMORALI Volumul 2 by Emil ANTON, Nicolae IOANID () [Corola-publishinghouse/Science/422_a_768]
-
mare, ca și evitarea stress-ului mecanic ce poate duce la fragmentarea ADN-ului genomic în cursul purificării. Detecția și identificarea unor secvențe specifice de acid nucleic constituie o procedură de rutină în biologia moleculară. SSCP - single strand conformational polymorphism (polimorfismul conformației catenelor unice) CDGE - constant denaturing gel electrophoresis (electroforeza în gel cu denaturare constantă) Prin metoda Southern blot, ADN-ul care conține secvența țintă este digerat cu una sau mai multe enzime de restricție, după care fragmentele sunt separate în funcție de mărime
CANCERUL GLANDEI MAMARE BIOLOGIE MOLECULARĂ ŞI MARKERITUMORALI Volumul 2 by Emil ANTON, Nicolae IOANID () [Corola-publishinghouse/Science/422_a_768]
-
au capacitatea de a-și crea o copie ADN a genomului lor (ARN), necesară perioadei în care se află în celulele eucariote. PCR poate fi utilizată și pentru detectarea mutațiilor punctiforme ale unei gene, direct sau indirect, prin studiul polimorfismului conformației catenelor unice de ADN (single strand conformational polymorphism - SSCP). Transferul proteinelor (Western blotting) a fost introdus inițial pentru a identifica antigenele proteice care leagă anticorpi specifici. Un amestec complex de proteine este separat prin electroforeză, după care proteinele sunt transferate
CANCERUL GLANDEI MAMARE BIOLOGIE MOLECULARĂ ŞI MARKERITUMORALI Volumul 2 by Emil ANTON, Nicolae IOANID () [Corola-publishinghouse/Science/422_a_768]
-
omoloage, cu secvențe P-box identice și, astfel, Erα și Erβ leagă diferite elemente ale răspunsului estrogenic, cu specificitate și afinitate similare [127]. AF 2 are rol în transcripția ligand-dependentă a receptorilor nucleari [88,134,202,279]. Liganzi diferiți induc conformații diferite ale receptorilor [49,340,351], acestea afectând eficacitatea sau potențialul ligandului. O altă diferență apare la nivelul situsului AP 1. În cazul Erα, agoniști tipici precum E2, ca și antiestrogenii (Tamoxifen) au aceeași eficacitate prin intermediul AP 1. În cazul
CANCERUL GLANDEI MAMARE BIOLOGIE MOLECULARĂ ŞI MARKERITUMORALI Volumul 2 by Emil ANTON, Nicolae IOANID () [Corola-publishinghouse/Science/422_a_768]
-
la guanina din nucleotidele ADN formând complexși sau aducți în ADN care afectează desfășurarea normală a sintezei replicative a acestei macromolecule. Se realizează complecși macromoleculari ADN-cDDP, aducții fiind formați la una sau la ambele catene ale duplexului ADN, modificându-se conformația dublului helix de la forma B la forma A sau la forma C. Legarea cDDP poate avea loc și la proteinele cromatinei cromozomilor cu același efect de denaturare a stereo structurii dublu helicale a ADN cu blocarea replicării sale normale și
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
unei familii mari de gene care codifică pentru proteinele ce leagă nucleotidul cu baza azotată guanină și care se numesc proteine G. Proteinele G reprezintă veritabili comutatori moleculari care reglează o varietate mare de căi de transducție a semnalului. În conformația lor activă, proteinele G leagă o moleculă de GTP și posedă o activitate enzimatică intrinsecă, prin care hidrolizează GTP legat și-l convertesc la GDP, revenind la starea de bază. Mutațiile în oncogenele activate ras anulează activitatea hidrolitică, iar proteina
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
proteinele G leagă o moleculă de GTP și posedă o activitate enzimatică intrinsecă, prin care hidrolizează GTP legat și-l convertesc la GDP, revenind la starea de bază. Mutațiile în oncogenele activate ras anulează activitatea hidrolitică, iar proteina rămâne în conformația sa activă. Mutații similare au fost descrise pentru genele ce codifică proteinele G convenționale. Proteinele G formează suprafamilia GTP-azelor, la care se adaugă proteinele RAS. Ele au o potențială activitate oncogenă. Activitatea lor este reglată prin legarea și hidroliza GTP
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
GGC (glicină) → GTC (valină) activează protooncogena H-ras, care devine oncogenă celulară. Structura proteinei RAS activă (care leagă GTP) și a celei inactive (care leagă GDP) a fost studiată comparativ și s-a dedus că proteina activată de GTP își schimbă conformația. Nu se cunoaște originea semnalului activării / inactivării RAS. Unele protooncogene codifică pentru factori de transcriere genică. Transcrierea genică este considerată ultima țintă pentru activitatea protooncogenelor. Unele proteine protooncogenice acționează direct în nucleu unde controlează expresia genelor celulare implicate în reglarea
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
transcriere codificați de protooncogene sunt proteine de tip HELIX-TURNHELIX (HTH) sau HELIX-LOOP-HELIX (HLH). Aceștia sunt formați din două catene polipeptidice în α-helix, unite printr-un sector buclat, linear, unii dintre ei având domenii de legare la ADN ce prezintă o conformație particulară. Există și alte tipuri de factori de transcriere. Astfel, au fost identificați factori de transcriere codificați de protooncogene care, asemănător genelor homeotice prezintă elemente structurale de tip homeobox. Astfel de factori de transcriere posedă homeodomenii, reprezentate prin secvențe specifice
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
prin intervenția directă sau indirectă în creșterea sau scăderea ratei de transcriere a anumitor gene, în celulele țintă. Steroizii pătrund în celulele țintă, difuzând prin membrana celulară și se leagă cu mare specificitate la receptorii lor intracelulari. Legarea steroidului modifică conformația receptorului, controlând activitatea acestuia ca proteină reglatoare a transcrierii. De exemplu, legarea hormonului la receptorul glucocorticoid determină translocarea sa în nucleu, unde se leagă la ADN și stimulează transcrierea genelor glucocorticoid-inductibile. Analize moleculare recente au evidențiat asemănări între receptorul de
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
servi la înțelegerea mecanismelor de inițiere și menținere a silențierii genice, precum și a modalităților de împachetare și decompactare selectivă a genomului mamalian, în așa fel încât să fie permisă transcrierea, respectiv, inactivarea genelor. O altă categorie de factori ce influențează conformația cromatinei și care sunt asociați cu oncogeneza o reprezintă proteinele non-histonice ce aparțin suprafamiliei HMG (High Mobility Group). Proteinele HMG sunt proteine nucleare ubicvitare ce reglează și facilitează diferite activități în care este implicat ADN, cum ar fi replicare, transcriere
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
fost asociată cu apariția leucemiei limfocitare cronice, limfom al cortexului cerebral și mielom (Călin și Croce, 2006). În diferite forme de cancere sunt implicate și dereglări în funcția unor proteine cu rol de modificatori ai cromatinei, funcționând ca remodelatori ai conformației cromatinice. Câteva enzime cu rol în modificarea histonelor, cum ar fi proteina Policomb (PcG), proteinele EZH2 și Tritorax (trxG) sau proteina MLL pot avea potențial oncogenic prin perturbarea identității epigenetice a celulei care conduce invariabil la silențieri sau activări neadecvate
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
nu conține domeniu transmembranar C-terminal, ci doar domeniu BH3 (Hsu și colab., 1997). Activitatea proapoptotică a proteinei BAD este determinată de fosforilare și heterodimerizarea sa cu proteine antiapoptotice. Proteina BAD fosforilată de către AKT/protein kinaza B determină apariția unei conformații permisive pentru formarea heterodimerului BAD-(14-3-3). Proteina BAD nefosforilată formează heterodimeri cu BCL-2 și BCL-XL, inactivându-le, permițând astfel complexului BAX/BAK să inițieze apoptoza. În urma fosforilării BAD, BCL-2 este liber pentru a determina inhibarea apoptozei. În concluzie, atunci când este în
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
APAF-1 sugerează că atașarea nucleotidelor induce modificări conformaționale ale acesteia care vor determina apariția unei structuri permisive pentru formarea apoptozomului activator al caspazei 9 în care APAF1 reprezintă regiunea centrală. Activarea căii mitocondriale determină eliberarea citocromului c care induce modificarea conformației Apaf-1 prin atașarea de domeniul CARD al proteinei. Atașarea ulterioară a unei molecule ATP induce o nouă modificare care determină deschiderea conformației APAF-1. Șapte molecule APAF-1 se atașează unele de altele prin intermediul domeniului CARD și de șapte molecule de caspaza-9
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
caspazei 9 în care APAF1 reprezintă regiunea centrală. Activarea căii mitocondriale determină eliberarea citocromului c care induce modificarea conformației Apaf-1 prin atașarea de domeniul CARD al proteinei. Atașarea ulterioară a unei molecule ATP induce o nouă modificare care determină deschiderea conformației APAF-1. Șapte molecule APAF-1 se atașează unele de altele prin intermediul domeniului CARD și de șapte molecule de caspaza-9, rezultând în final apoptozomul, care va determina activarea caspazelor efectorii (Corvaro și Cecconi, 2004). Mutații heterozigote în gena Apaf-1 (10-15% cazuri) au
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
cu Apaf-1 (de la apoptosis proteaseactivating factor-1). Domeniul BIR3 al XAIP formează un heterodimer cu caspaza 9 monomerică și astfel previne dimerizarea și activarea acesteia. În plus, blocarea caspazei 9 într-o formă monomerică menține situsul activ al enzimei într-o conformație inactivă (Shiozaki și colab., 2003). De asemenea, legarea proteinelor IAP de caspaza 3, substrat al caspazei 8, inhibă cascada proteolitică și calea apoptotică - Fas/caspaza 8 (Deveraux, 1997). Supraexpresia proteinei ILP2 nu inhibă apoptoza indusă de către receptorii death (Fas sau
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
asemenea compuși, fără să se cunoască ce stă la baza unei asemenea acțiuni selective. Cercetările lui J. Kurian (2000) au elucidat mecanismul prin analiza structurii cocristaline a lui STI.571, legat la domeniul Abl kinazei. Medicamentul se leagă preferențial la conformația inactivă a kinazei, blocând astfel activarea acestei enzime. Deși kinazele sunt foarte asemănătoare în starea lor activă, ele prezintă particularități individuale în conformațiile lor inactive, ceea ce reprezintă o premiză a țintirii selective a acestor actori esențiali ai mecanismului transformării maligne
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
analiza structurii cocristaline a lui STI.571, legat la domeniul Abl kinazei. Medicamentul se leagă preferențial la conformația inactivă a kinazei, blocând astfel activarea acestei enzime. Deși kinazele sunt foarte asemănătoare în starea lor activă, ele prezintă particularități individuale în conformațiile lor inactive, ceea ce reprezintă o premiză a țintirii selective a acestor actori esențiali ai mecanismului transformării maligne, astfel că țintirea selectivă a kinazelor este în acest moment o realitate farmacologică și mulți compuși cu un asemenea efect au intrat deja
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]