959 matches
-
genice V are un promotor, aflat inițial la mare distanță de enhancer. În urma rearanjării segmentelor genice imunoglobulinice într-o genă funcțională, promotorul segmentului genic inclus în suprasegmentul genic V-D-J vine mult mai aproape de enhancer, cade sub influența acestuia și astfel transcripția genei imunoglobulinice asamblate este realizată cu o rată mai mare. Dacă enhancer-ul este deletat în cadrul rearanjamentului de segmente genice imunoglobulinice în limfocitele mature, transcripția genei imunoglobulinice este dramatic diminuată. Mai multe motive de secvență distinctive definesc promotorul bazal al unei
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
inclus în suprasegmentul genic V-D-J vine mult mai aproape de enhancer, cade sub influența acestuia și astfel transcripția genei imunoglobulinice asamblate este realizată cu o rată mai mare. Dacă enhancer-ul este deletat în cadrul rearanjamentului de segmente genice imunoglobulinice în limfocitele mature, transcripția genei imunoglobulinice este dramatic diminuată. Mai multe motive de secvență distinctive definesc promotorul bazal al unei gene imuno-globulinice și anume o secvență asemănătoare TATA, situată în sectorul de 20-30 perechi de nucleotide față de situsul start al transcripției. Această secvență este
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
în limfocitele mature, transcripția genei imunoglobulinice este dramatic diminuată. Mai multe motive de secvență distinctive definesc promotorul bazal al unei gene imuno-globulinice și anume o secvență asemănătoare TATA, situată în sectorul de 20-30 perechi de nucleotide față de situsul start al transcripției. Această secvență este un octamer conservat (octa) 5’-ATGCAAAT-3’, localizat la aproximativ 30-60 perechi de baze depărtare, în amonte față de situsul de start al transcripției, și o secvență heptamerică consens (hepta) 5’-ATGCAAT-3’ situată la aproximativ 25 perechi de baze
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
secvență asemănătoare TATA, situată în sectorul de 20-30 perechi de nucleotide față de situsul start al transcripției. Această secvență este un octamer conservat (octa) 5’-ATGCAAAT-3’, localizat la aproximativ 30-60 perechi de baze depărtare, în amonte față de situsul de start al transcripției, și o secvență heptamerică consens (hepta) 5’-ATGCAAT-3’ situată la aproximativ 25 perechi de baze în amonte de octamer (fig. 4.3). Pentru transcripție și pentru specificitatea celulară, cel mai important motiv al promotorului bazal este secvența octamerică. Excizia acestui
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
-ATGCAAAT-3’, localizat la aproximativ 30-60 perechi de baze depărtare, în amonte față de situsul de start al transcripției, și o secvență heptamerică consens (hepta) 5’-ATGCAAT-3’ situată la aproximativ 25 perechi de baze în amonte de octamer (fig. 4.3). Pentru transcripție și pentru specificitatea celulară, cel mai important motiv al promotorului bazal este secvența octamerică. Excizia acestui motiv compromite activitatea transcripțională a promotorului. Pe de altă parte, inserția unui segment octameric într-un promotor care în mod normal nu este transcris
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
pentru specificitatea celulară, cel mai important motiv al promotorului bazal este secvența octamerică. Excizia acestui motiv compromite activitatea transcripțională a promotorului. Pe de altă parte, inserția unui segment octameric într-un promotor care în mod normal nu este transcris, determină transcripția în celulele B. Deleția heptamerului reduce expresia bazală a genei CH de aproape cinci ori, dar nu se știe mai nimic despre modul în care acesta conferă specificitate limfocitelor B. Promotorul bazal al unei gene Ig pentru catena L(κ
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
de tip TATA și octamer, numai că secvența octamer din promotorul IgL(κ) are orientare opusă. Toți promotorii genei IgL(κ) conțin un element pentadecanucleotidic la aproximativ 100 perechi de nucleotide. Secvențele de tip TATA și octamer sunt esențiale pentru transcripția genei IgL(κ), numai că rolul pentadecanucleotidului este neclar, deoarece eliminarea sa nu afectează transcripția. Transcripția optimă a genelor CH(κ) are la bază integritatea enhancerilor corespunzători lor. Enhancer-ul CH este localizat în întregime în intronul care precede primul exon
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
opusă. Toți promotorii genei IgL(κ) conțin un element pentadecanucleotidic la aproximativ 100 perechi de nucleotide. Secvențele de tip TATA și octamer sunt esențiale pentru transcripția genei IgL(κ), numai că rolul pentadecanucleotidului este neclar, deoarece eliminarea sa nu afectează transcripția. Transcripția optimă a genelor CH(κ) are la bază integritatea enhancerilor corespunzători lor. Enhancer-ul CH este localizat în întregime în intronul care precede primul exon dinspre capătul 5’ al regiunii constante CH. În secvența genică pentru CL(κ) au fost
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
Toți promotorii genei IgL(κ) conțin un element pentadecanucleotidic la aproximativ 100 perechi de nucleotide. Secvențele de tip TATA și octamer sunt esențiale pentru transcripția genei IgL(κ), numai că rolul pentadecanucleotidului este neclar, deoarece eliminarea sa nu afectează transcripția. Transcripția optimă a genelor CH(κ) are la bază integritatea enhancerilor corespunzători lor. Enhancer-ul CH este localizat în întregime în intronul care precede primul exon dinspre capătul 5’ al regiunii constante CH. În secvența genică pentru CL(κ) au fost depistați
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
unității transcripționale. Enhancerii imunoglobulinici prezintă trăsăturile specifice acestor clase de elemente reglatoare. Fiecare enhancer este funcțional indiferent de orientarea sa 3’ - 5’sau 5’ - 3’ și indiferent de distanța și locația în care se află în raport cu situsul de start al transcripției. Totodată, fiecare enhancer poate activa transcripția promotorilor heterologi. O trăsătură importantă a enhancer-ilor este preferința funcționării lor în limfocitele B. Enhancer-ul CH apare a fi activ în toate stadiile de dezvoltare a celulei B, ceea ce reprezintă un indiciu al faptului
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
specifice acestor clase de elemente reglatoare. Fiecare enhancer este funcțional indiferent de orientarea sa 3’ - 5’sau 5’ - 3’ și indiferent de distanța și locația în care se află în raport cu situsul de start al transcripției. Totodată, fiecare enhancer poate activa transcripția promotorilor heterologi. O trăsătură importantă a enhancer-ilor este preferința funcționării lor în limfocitele B. Enhancer-ul CH apare a fi activ în toate stadiile de dezvoltare a celulei B, ceea ce reprezintă un indiciu al faptului că acțiunea sa are specificitate celulară
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
celulei B, ceea ce reprezintă un indiciu al faptului că acțiunea sa are specificitate celulară, nu însă și specificitate de stadiu. Pe de altă parte, enhancerii CL pot avea deopotrivă specificitate celulară și specificitate de stadiu, deoarece, spre a fi inițiată transcripția genei imunoglobulinice rearanjată pentru catena ușoară, pare a fi necesară inducția subsecventă rearanjamentului genic. Elementul enhancer (EH ) se află în intronul dintre regiunea variabilă (VDJ) și regiunea constantă (C). Promotorul IgLK conține o cutie TATA și un octamer opus orientat
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
a fi necesară inducția subsecventă rearanjamentului genic. Elementul enhancer (EH ) se află în intronul dintre regiunea variabilă (VDJ) și regiunea constantă (C). Promotorul IgLK conține o cutie TATA și un octamer opus orientat, aflat în amonte de situsul start al transcripției și enhancer-ul său EK este dispus în intronul dintre regiunea variabilă (VJ) și regiunea constantă (CK), (din Singer și Berg, 1991). Indiciul inițial că enhancerii conțin motive discrete de secvență care servesc ca situsuri de legare a proteinei s -a
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
loc legarea de proteine la o secvență ADN, acea secvență va fi protejată față de modificările chimice. Cum protecția a apărut în mod preferențial la nivelul genelor exprimate în celulele B, s-a dedus că proteinele legate au fost factori de transcripție cu specificitate celulară. La nivelul enhancer-ului CH au fost evidențiate patru secvențe protejate, iar la nivelul enhancer-ului CL(κ) au fost evidențiate trei asemenea secvențe și au fost desemnate motivele EH, respectiv EK (fig. 4.4). Fiecare dintre aceste motive
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
CH conține și trei repetiții ale secvenței miez (CH1-3) care a fost descrisă anterior în regiunea enhancer timpurie a virusului SV40 și aceeași secvență octamer a fost identificată și în promotorul bazal. Există în regiunea enhancer și secvențe care inhibă transcripția în celule nonlimfoide, deoarece unele deleții din regiunea enhancer se asociază cu intensificarea transcripției în fibroblaste, pe când în celulele limfoide activitatea transcripțională este relativ neschimbată, în asemenea cazuri. Diferențieri în expresia genelor imunoglobulinice sunt determinate și de prezența silențiatorilor, dar
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
în regiunea enhancer timpurie a virusului SV40 și aceeași secvență octamer a fost identificată și în promotorul bazal. Există în regiunea enhancer și secvențe care inhibă transcripția în celule nonlimfoide, deoarece unele deleții din regiunea enhancer se asociază cu intensificarea transcripției în fibroblaste, pe când în celulele limfoide activitatea transcripțională este relativ neschimbată, în asemenea cazuri. Diferențieri în expresia genelor imunoglobulinice sunt determinate și de prezența silențiatorilor, dar caracterizarea acestor regiuni reglatoare este încă fragmentară și inconsistentă. Analiza alterărilor mutaționale de la nivelul
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
de către diferiți factori precum lipopolizaharidul bacterian, cicloheximida și esterii de forbol, această trăsătură pierzându-se în cazul mutațiilor care afectează motivul B. De aici, s-a dedus că secvența B este esențială atât în funcția enhancerului, cât și pentru inducția transcripției genei pentru catena ușoară κ. Interesant este că motivul B se întâlnește și în promotorii și enhancer-ii care funcționează în celule nonlimfoide, în anumite situații, asemenea promotori fiind inductibili de către aceiași compuși care activează expresia genei pentru catena ușoară κ
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
nonlimfoide, în anumite situații, asemenea promotori fiind inductibili de către aceiași compuși care activează expresia genei pentru catena ușoară κ, în limfocite. Asemenea observații pot fi explicate luând în considerație proprietățile NF-kB. Promotorii și enhancer-ii proximali ai genelor Ig contribuie la transcripția cu specificitate limfoidă B. Motivele octamer în promotorul bazal și enhancer-ul genelor C H reprezintă cele mai importante secvențe determinatoare ale acestei specificități celulare. Celulele lipsite de proteine de legare la un octamer cu specificitate de celulă B sunt incapabile
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
cu specificitate de stadiu târziu în dezvoltarea celulei B depinde de interacțiunea unui motiv kB cu proteina NF-kB. Factori transactivatori ai genelor imunoglobulinice sunt reprezentați de diferite proteine cu specificitate pentru secvențele genice imunoglobulinice. Factorii proteinici necesari asamblării mașinăriei de transcripție în vecinătatea secvenței TATA și a situsului start transcripțional sunt transactivatori tipici. În plus, promotorii bazali din genele pentru catenele grele și pentru catena ușoară de tip κ necesită pentru activarea lor o proteină cu specificitate limfocitară - o proteină de
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
la octamer. Au fost descrise două tipuri de proteine de legare la octamer: unul întâlnit în majoritatea celulelor de la mamifere care a fost desemnat OTF-1 și altul întâlnit numai în limfocite desemnat OTF-2 acesta din urma fiind esențial pentru activarea transcripției cu specificitate limfoidă, atât din promotorul bazal al genei pentru catena grea, cât și din promotorul bazal al genei pentru catena L de tip κ. Ambele aceste proteine se pot lega aproximativ cu aceeași eficiență la secvența octamer și protejează
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
catena L de tip κ. Ambele aceste proteine se pot lega aproximativ cu aceeași eficiență la secvența octamer și protejează aceleași secvențe nucleotidice față de clivarea cu DNază I și metilarea indusă de dimetilsulfat. Deoarece celulele limfoide conțin atât factorul de transcripție OTF-1, cât și factorul de transcripție OTF-2, ele exprimă un spectru larg de gene care au în promotorii lor motivul octamer. Paradoxul apare însă în situația în care acești promotori eșuează în a funcționa în celulele care conțin OTF-1, dar
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
aceste proteine se pot lega aproximativ cu aceeași eficiență la secvența octamer și protejează aceleași secvențe nucleotidice față de clivarea cu DNază I și metilarea indusă de dimetilsulfat. Deoarece celulele limfoide conțin atât factorul de transcripție OTF-1, cât și factorul de transcripție OTF-2, ele exprimă un spectru larg de gene care au în promotorii lor motivul octamer. Paradoxul apare însă în situația în care acești promotori eșuează în a funcționa în celulele care conțin OTF-1, dar nu conțin OTF-2. Răspunsul la această
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
promotori eșuează în a funcționa în celulele care conțin OTF-1, dar nu conțin OTF-2. Răspunsul la această ciudățenie are la bază presupunerea că legarea OTF-2 la motivul octamer al genei Ig este suficientă prin ea însăși, spre a activa inițierea transcripției, pe când legarea doar a lui OTF-1 este insuficientă în inducerea acestei activări (Sing și Berg, 1991). Activarea prin OTF-1 ar putea să necesite interacțiunea cu unul sau mai mulți factori adiționali legați la motive învecinate. De exemplu, promotorul timpuriu din
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
să necesite interacțiunea cu unul sau mai mulți factori adiționali legați la motive învecinate. De exemplu, promotorul timpuriu din genomul SV40, ca și alți asemenea promotori conțin mai multe motive secvențiale cu valoare de situsuri de legare a factorilor de transcripție adiacente motivului octameric. Totodată, este de admis că spațierea dintre secvența TATA și secvența octamer din promotorii bazali Ig este diferită față de aceea care se întâlnește în promotorii exprimați ubicuitar. S- a realizat clonarea cADN codificator de proteine OTF-1 și
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
și OTF-2 prezintă o secvență de aminoacizi aproape identică, la nivelul domeniilor lor de legare la ADN, divergența apărând în alte regiuni ale catenei lor polipeptidice. Domeniile divergente reflectă necesitatea ca aceste proteine să interacționeze și cu alți factori de transcripție cu specificitate diferită de gene sau de celule. În plus, influența secvențelor flancatoare ale octamerului asupra afinității de legare a OTF-1 sugerează că această proteină posedă o considerabilă versatilitate în capacitatea sa de a influența transcripția multor gene. Fiecare dintre
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]