261 matches
-
tipuri de translocații t(11;14) (p13; q11) și t(7;11) (q35; p13) sunt implicate fie TCR-α, fie TCR-δ, din 14q11, sau TCR-β, din 7q35. Punctele de rupere la 11p13 apar la nivelul unor secvențe care au o mare omologie cu o secvență heptamerică canonică ce poate fi recunoscută în mod normal de aparatul enzimatic al recombinazelor. Recombinaza este responsabilă de reunirile anormale ale segmentelor cromozomale, deoarece adesea ambii cromozomi reciproc translocați au o adiție nucleotidică în regiunea N - semn
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
această anomalie fuzionează gena e2a, la gena hlf pentru o proteină leucin-zipper, care nu este exprimată în mod normal în celulele limfoide. Majoritatea genelor activate sau create prin anomalii cromozomale joacă un rol probabil în proliferarea celulară specifică tumorilor, datorită omologiei și identității lor cu genele identificate în alte sisteme experimentale și care influențează dezvoltarea și diferențierea. Perturbările acestor procese pot determina blocaje care conduc la acumularea celulelor proliferative imature sau a celulelor maligne. Oncogeneza ce are la bază dereglări ale
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
care devine un transactivator mult mai puternic decât proteina singulară PAX3. Și în tumorile solide benigne apar anomalii cromozomale care au ca rezultat fuziuni genice. Genele aflate în punctele de rupere din translocații sunt înalt conservate în evoluția lumii vii, omologia lor la specii aflate pe trepte diferite ale scării filogenetice (Saccharomyces, Caenorhabditis, Drosophila și Homo sapiens sapiens) fiind bine dovedită. Exemplu notabil este cel al omologiei genei bcl 2, caracteristică leucemiei /limfomului cu celule B, genă cartată 18q22 și identificată
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
aflate în punctele de rupere din translocații sunt înalt conservate în evoluția lumii vii, omologia lor la specii aflate pe trepte diferite ale scării filogenetice (Saccharomyces, Caenorhabditis, Drosophila și Homo sapiens sapiens) fiind bine dovedită. Exemplu notabil este cel al omologiei genei bcl 2, caracteristică leucemiei /limfomului cu celule B, genă cartată 18q22 și identificată în punctul de rupere din translocația t(14;18) din limfomul folicular, precum și cel al genei ced-9, de la viermele nematod Caenorhabditis elegans, implicată în reglarea și
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
o bază științifică pentru căutarea unor noi gene care pot contribui la susceptibilitatea pentru cancerul de sân și pentru managementul clinic al persoanelor predispuse la această boală. Analiza structurii genelor brca1 și brca2 arată că, deși aceste gene prezintă o omologie de secvență limitată, ele au trăsături structurale și funcționale similare. Genele brca1 și brca2 au dimensiuni mari. Gena brca1 ocupă un sector de 80 kb și este transcrisă într-un preARN, de 7,8 kb iar gena brca2 ocupă un
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
este codificator, iar exonul 11 este neobișnuit de mare, având 3,4 kb, în brca1, și 11,5 kb, în brca2. Dimensiunea mare a exonului 11 din cele două gene explică parțial numărul mare de mutații identificate la acest nivel. Omologia la nivelul structurii primare a BRCA1 și BRCA2 de la specia umană cu corespondenții lor murini este de aproximativ 60%. La nivelul ambelor proteine există domenii scurte, care sunt mai bine conservate, dar și regiuni care prezintă o diversitate semnificativă. Unele
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
în apoptoza dependentă de P53 (Yoshida și colab., 1998; Cecconi și colab., 1998). Recunoașterea procaspazei 9 de către APAF-1 se realizează inițial prin intermediul interacției CARD-CARD și este esențială pentru formarea holoenzimei și activarea caspazei 3. Domeniile CARD ale APAF-1 au 20% omologie cu prodomeniile CARD ale procaspazei 9 (Hofmann și Bucher, 1997). Domeniul CARD adoptă o structură compactă, globulară, cu șase α-helixuri împachetate intim în jurul unui miez hidrofob. Helixul H1 al CARD, atât în APAF-1 cât și în procaspaza-9 este puternic pliat
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
complexului TNFβ/TNF-R1 și generează un set diferit de interacțiuni. În contrast cu efectele proliferative care caracterizează activitatea majorității citokinelor, TNF, FAS L și ligandul TRAIL/APO-2 (APO-2L) sunt capabili de a induce eliminarea rapidă a țintelor lor celulare. APO-2L are o omologie de 23,2% cu FAS L la nivel de structură primară. Ea prezintă o topologie proteinică transmembranară de tip II, cu un situs potențial de clivare în regiunea terminală. Cap. 30. Apoptoza în tumorigeneză Figura 30.2. Etapele inducerii semnalizării
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
și 10) sunt activate prin interacțiunea cu DISC; caspaza-9 este activată de către apoptosom, iar caspazele efectoare (din aval) 3, 6 și 7 clivează proteinele implicate în evenimentele apoptotice (Shi, 2005). Zece dintre cele 11 gene umane legate de apoptoză prezintă omologie cu gena ced-3 de la nematodul C. elegans. Caspazele sunt exprimate ca precursori zimogenici de 30-50 kDa și devin proteaze active numai după clivarea lor specifică. În general, structura unei caspaze este conservată, conținând un prodomeniu la capătul amino-terminal și un
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
FLIP. 30.2.5.1. Caspaza-1 (ICE) Caspazele -1, -8 și -10 activează caspaza-3. Primul omolog (ICE) al lui ced-3 de la nematod, identificat la mamifere, a fost enzima transformantă a interleukinei 1β (IL-1β) (Xue și colab., 1996). Gena ced-3 prezintă omologie de 29% la nivelul structurii primare cu această enzimă. Liniile celulare stabilizate secretă forma matură IL-1β fără a induce apoptoza. Șoarecii cu mutații în gena Ice, care sunt incapabili de a genera IL-1β activă, nu manifestă un deficit apoptotic pronunțat
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
conține 479 aminoacizi, are 55391Da și este un heterotetramer alcătuit din doi heterodimeri antiparaleli, fiecare conținând: P18 (18kDa) și P10 (10kDa). Splicing-ul alternativ determină apariția a nouă isoforme. La om, FAS, FADD și caspaza-8 au 42%, 52% și respectiv 52% omologie de secvență de aminoacizi. Caspaza-8 este mai abundentă comparativ cu caspaza-10. Celulele de tip I produc cantități însemnate de caspază-8 activă la nivelul DISC și această cantitate mare de caspază-8 poate cliva direct caspazele efectoare, ocolind calea mitocondrială. Celulele de
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
caracterizează folderele morții sunt înalt specifice, rolul lor de bază fiind cel de auto-asamblare. DD este localizat intracelular, în timp ce DED și CARD se găsesc în proteinele adaptoare, precum FADD și procaspaze. Între diferitele domenii ale morții există o identitate de omologie de secvență de ~20%. Această regiune este înalt conservată la om, șoarece și șobolan și corespunde resturilor 1-95. Toate cele trei module de semnalizare (DD, DED și CARD) conțin un centru conservat de aminoacizi hidrofobi. Cele patru familii prezintă structuri
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
și P loop) (Deveraux, 1999). Domeniul BIR este important pentru inhibiția caspazelor, iar motivul P loop este necesar pentru legarea nucleotidelor. Aceste elemente structurale sunt prezente în diferite combinații în structura proteinelor IAP, conferindu-le diversitate structurală și funcțională. În funcție de omologia domeniilor BIR și de prezența sau absența domeniului RING finger, aceste proteine au fost grupate în trei clase (fig. 30.3). Clasa 1. În această clasă sunt incluse proteinele XIAP, cIAP1, cIAP2, ILP2 și ML-IAP, caracterizate prin prezența a trei
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
și timus (Schimmer, 2004). cIAP1 și cIAP2 sunt înrudite structural cu XIAP și inhibă caspazele 3 și 7, iar cIAP2 și caspaza 2 (Cheung, 2006). ML-IAP și ILP2 au un domeniu RING finger și un singur domeniu BIR, care prezintă omologie crescută cu BIR 3 al celorlalte proteine din această clasă (Schimmer, 2004). ML-IAP este exprimată în ficatul fetal, rinichi, testiculele adulte și timus, dar și în linii celulare de melanoame (nu însă și în melanocitele normale) și limfoame, iar ILP2
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
cât și in vitro, presupune legarea domeniilor BIR de situsurile active ale caspazelor. Această legare determină degradarea caspazelor active sau abolirea capacității acestora de a interacționa cu caspazele substrat (Wei și colab., 2000). Proteina XIAP prezintă trei domenii BIR cu omologie crescută, care interacționează în mod diferit cu caspazele: domeniul BIR2 și regiunea linker dintre BIR1 și 2 se leagă specific de caspazele -3 și -7, iar domeniul BIR3 inhibă caspaza -9, fără o contribuție aparentă a regiunii linker. Interpunerea domeniului
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
NAIP, s-a observat că supraexpresia acesteia este asociată cu cancerul de ovar, diverse adenocarcinoame, limfoame, cancerul de pancreas și cancerul de sân. 30.3.3.1. Gena pentru proteina Survivin Gena pentru proteina Survivin a fost identificată pe baza omologiei de structură a produsului său Survivin cu proteinele IAP în celulele umane B limfoblastice (Ambrosini și colab., 1997). Această proteină reprezintă un membru unic al familiei IAP, atât din punct de vedere structural cât și funcțional, deoarece ea are un
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
de rezistență la STI-571 și alți inhibitori kinazici cu moleculă mică în teste clinice în care se iau în analiză alte tipuri de cancer, în afară de LCM, la care ar trebui să funcționeze mecanisme similare de rezistență, deoarece țintele kinazice prezintă omologie în regiunea domeniului kinazic. Scopul inițial al testelor clinice cu cele mai multe medicamente antitumorale este acela de a determina doza maximă de medicament tolerată ce poate fi administrată pacientului în condiții de securitate, precum și de a stabili rata răspunsului într-un
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
de gene pe orizontală, bine caracterizat, având o suită de oncogene care, atunci când sunt integrate în genomul plantei gazdă orchestrează biosinteza de novo a auxinei și citokininei, spre a genera tumori. În mod specific, oncogenele iaaM și ipt care au omologie de aproximativ 90% la diferitele tulpini de A. tumefaciens, sunt nemijlocit implicate în tumorigeneză. Autorii au realizat două constructe moleculare desemnate să inițieze sinteza ARN de interferență (iARN) pentru cele două oncogene, generându-se plante transgenice de Arabidopsis thaliana și
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
linii biovar de A. tumefaciens, evidențiindu-se tumorigeneză între 0,0% și 24,2%, pe când plantele martor au prezentat 100% tumorigeneză. Acest mecanism de rezistență durabilă la tumorigeneză este mediat de silențierea bacteriooncogenelor prin intermediul i-ARN și se bazează pe omologia de secvență a ARNm, mai curând, decât pe interacțiunile înalt specifice receptor-ligand, descrise în cazurile tradiționale de rezistență a plantelor la agenți patogeni. Un asemenea mecanism de silențiere a bacteriooncogenelor poate avea semnificații majore practice în ameliorarea plantelor de cultură
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
de hormoni vegetali (auxine și citokinine) fiind modificată sensibilitatea fitohormonală a gazdei, ceea ce determină inițierea unui proces necontrolat, anarhic de creștere / diviziune celulară, finalizat cu formarea tumorii vegetale. Regiunea oncogenă a T-ADN reprezintă „secvența miez” deoarece ea prezintă înaltă omologie de secvență printre toate sușele virulente de A. tumefaciens. Escobar și colaboratorii (2001) au pus la punct o strategie de combatere a cancerului de colet la plantele de cultură (tumorigeneză) prin utilizarea interferenței ARN (iARN) vizând silențierea bacteriooncogenelor iaaM și
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
AMP și izopentenilpirofosfatului spre a se forma citokinin zeatina. Expresia ambelor aceste bacteriooncogene în celula gazdă este necesară și suficientă pentru formarea tumorilor de colet ale plantelor, în natură. Interferența ARN (iARN) este o formă de silențiere genică dependentă de omologie comună fungilor, animalelor și plantelor. Există specificități diferențiatoare ale acestui fenomen pentru fiecare regn, dar inițiatorul universal al iARN pare a fi un ARN dublu catenar. La plante, expresia ARN-urilor complementare din constructe transgenice introduse în cercetări experimentale s-
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
genele autocomplementare iaaM și ipt conduse de promotorii virusului mozaicului conopidei. Deși A. tumefaciens prezintă o mare diversitate în organizarea structurală a ADN genomic și a plasmidului Ti, la diferitele sușe virulente, toate acestea prezintă oncogene care manifestă o mare omologie de organizare și funcționare în inducerea tumorigenezei la plante. Escobar și colaboratorii (2001) au valorificat aceste particularități genomice spre a obține rezistență la tumorigeneza de colet, prin țintirea oncogenelor iaaM și ipt pe calea silențierii genice mediate de iARN. Căile
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
ale patogenilor pot altera interacțiunile proteină-proteină, spre a iniția un răspuns de apărare. Totuși, întrun sistem de rezistență mediat de iARN, mutația este improbabilă să altereze rapid secvența genică țintă la un nivel la care silențierea genică dependentă de o omologie de 70% să nu mai fie posibilă. Faptul că tumorigeneza este uniform inhibată în liniile transgenice sugerează că silențierea transcriptelor iaaM și ipt este independentă de structura, locația și numărul de copii ale locusului țintă din ADN genomic al gazdei
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
ideii saussureene, potrivit căreia nu numai elementele, ci și organizarea este arbitrară, constă în faptul că instituie în lume obiecte noi, necunoscute și chiar imprevizibile înaintea ordinii care le constituie. Această nouă regiune a existenței - dacă admitem limbajul prudent al omologiilor regionale - este alături de Lucru și Idee, Semnul, alături de Realitate și Cunoaștere, Comunicarea, alături de Lume și Conștiință, Limba. Garanția că ne aflăm în preajma unei noi perspective filosofice ne-o oferă noul tip de totalitate astfel propus. Caracteristicile ce singularizează acest sistem
Semn și interpretare by Aurel Codoban [Corola-publishinghouse/Science/295577_a_296906]
-
noi axe transversale față de prima. In cazul muzicii, structura, într-un fel dezlipită de sens, aderă la sunet; în cazul mitologiei, structura dezlipită de sunet aderă la sens." (16/ I, p. 578) Situarea sistemelor mitologice printre sistemele semnificante, stabilirea unei omologii între acest sistem și sistemul limbii pentru care structura este cea care constituie elementele și este esențială pentru sistem, însoțită de contestarea interpretării miturilor ca explicații ale fenomenelor, ori ca glosă moralizatoare a condiției umane, schimbă nivelul analizei: etnologul occidental
Semn și interpretare by Aurel Codoban [Corola-publishinghouse/Science/295577_a_296906]