KorAP: Find »[drukola/base=aminoacid & drukola/pos=noun]« with Poliqarp

<1 ...48 49 50 ...176 >

4,386 matches

Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483

au identificat o genă importantă pentru susceptibilitatea la neoplazia mamară și ovariană pe care au denumit-o brca1 (Breast cancer 1). Gena brca1 (17q 12-21) are 24 exoni și codifică pentru o proteină multidomeniu care are o secvență de 1863 aminoacizi (fig. 26.1). Cercetările coordonate de către Consorțiul de Linkage al Cancerului de Sân (BCLC) au confirmat localizarea genei brca1 și au demonstrat că majoritatea familiilor în care apare neoplazie de sân și ovar prezintă alterări în anumite situsuri ale acestei

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
de ADN de aproximativ 80 kb și este transcrisă într-un preARNm de 10,4 kb. Ambele gene prezintă o structură complexă (brca1 are 24 exoni, iar brca2 are 27 exoni), codifică pentru proteine foarte mari (proteina BRCA1 are 1863 aminoacizi, iar proteina BRCA2 are 3418 aminoacizi) și prezintă pattern-uri de expresie spațială și temporală asemănătoare. În ambele gene, exonul 1 nu este codificator, iar exonul 11 este neobișnuit de mare, având 3,4 kb, în brca1, și 11,5

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
și este transcrisă într-un preARNm de 10,4 kb. Ambele gene prezintă o structură complexă (brca1 are 24 exoni, iar brca2 are 27 exoni), codifică pentru proteine foarte mari (proteina BRCA1 are 1863 aminoacizi, iar proteina BRCA2 are 3418 aminoacizi) și prezintă pattern-uri de expresie spațială și temporală asemănătoare. În ambele gene, exonul 1 nu este codificator, iar exonul 11 este neobișnuit de mare, având 3,4 kb, în brca1, și 11,5 kb, în brca2. Dimensiunea mare a

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
identificat un motiv RING finger înalt conservat. Deoarece aceste motive sunt implicate în interacțiunile proteină-proteină, se consideră că acestă regiune din proteină reprezintă situsul de dimerizare pentru BRCA1 și BARD1. În partea centrală a moleculei BRCA1 se află secvențe de aminoacizi care sunt importante pentru localizarea nucleare a proteinei (NLS) și pentru legarea proteinelor codificate de genele p53, rb, rad50 și rad51. Proteinele RAD50 și RAD51 sunt implicate în mecanismul de recombinare mitotică și meiotică și în cel de repararea a

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
proteinelor codificate de genele p53, rb, rad50 și rad51. Proteinele RAD50 și RAD51 sunt implicate în mecanismul de recombinare mitotică și meiotică și în cel de repararea a leziunilor din ADN. Spre capătul carboxil terminal al BRCA1, între resturile de aminoacizi 1699-1736 și 1818-1855, există două domeniile BRCT. Secvența acestor domenii este puternic conservată în proteina BRCA umană și murină. Sectorul C-terminal al proteinei BRCA1 este implicat în repararea leziunilor ADN. În plus, regiunile cuprinse între aminoacizii 1214-1223 din BRCA1

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
între resturile de aminoacizi 1699-1736 și 1818-1855, există două domeniile BRCT. Secvența acestor domenii este puternic conservată în proteina BRCA umană și murină. Sectorul C-terminal al proteinei BRCA1 este implicat în repararea leziunilor ADN. În plus, regiunile cuprinse între aminoacizii 1214-1223 din BRCA1 și 3334-3344 din BRCA2, prezintă similitudine cu secvența consens a graninei. Graninele sunt implicate în prelucrarea proteinelor secretate ca răspuns la stimuli extracelulari și se pot autocliva pentru a forma peptide bioactive. BRCA2 nu conține domenii BRCT

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
autocliva pentru a forma peptide bioactive. BRCA2 nu conține domenii BRCT sau RING finger și are o asemănare limitată cu secvențele înregistrate în băncile publice de date. În regiunea cuprinsă între resturile 1000 și 2030 există opt repetiții de 20-30 aminoacizi, numite repetițiile BRC. Singura proteină care conține o secvență similară a fost identificată la nematodul Caenorhabditis elegans și are o funcție necunoscută. BRCA2 se leagă de RAD51, omologul genei Rec A de la E. coli, cu rol important în recombinarea și

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
au dimensiuni reduse, pot predispune la apariția de microdeleții în secvența brca1. În prezent rămâne problematică discriminarea mutațiilor care predispun la neoplazie, de polimorfismele genetice care nu au semnificație patologică. Mutația desemnată 5677 ins A, care determină deleția a 10 aminoacizi de la capătul carboxi terminalul al BRCA1, este clar asociată cu susceptibilitatea la neoplazie și reprezintă un argument că această regiune a proteinei îndeplinește funcții importante. Pe de altă parte, 93 aminoacizi de la capătul carboxil terminal al BRCA2, care sunt slab

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
desemnată 5677 ins A, care determină deleția a 10 aminoacizi de la capătul carboxi terminalul al BRCA1, este clar asociată cu susceptibilitatea la neoplazie și reprezintă un argument că această regiune a proteinei îndeplinește funcții importante. Pe de altă parte, 93 aminoacizi de la capătul carboxil terminal al BRCA2, care sunt slab conservați în cursul evoluției, nu sunt necesari pentru multe dintre funcțiile acestei proteine, iar eliminarea lor prin mutație (deleție) nu se asociază cu un fenotip patologic. În unele cazuri au fost

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
pentru brca1, care mor în cursul vieții intrauterine. Se poate reconcilia un asemenea caz, admițând că în cazul pacientei formele alternative de splicing ale BRCA1 au o activitate reziduală, sau că proteina BRCA1 trunchiată (estimată a fi alcătuită din 900 aminoacizi și prezentând un domeniu RING) este suficientă pentru a-și exercita funcția normală, în cursul dezvoltării. Deoarece datele actuale nu sprijină nici una dintre aceste două ipoteze, se consideră că organizarea și mecanismele de reglarea ale genelor brca la om și

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
specifică și nespecifică, sunt eficiente în detectarea și liza celulelor tumorale izolate și transplantate. Deoarece detectează celulele tumorale izolate, ele sunt eficiente în prevenirea metastazelor, dar sunt ineficiente față de celulele care au constituit deja o microtumoră. Arginina (Arg) este un aminoacid dibazic, sintetizat în cantități adecvate pentru menținerea echilibrului azotat. Necesarul dietetic asigură creșterea optimă a organismelor tinere, la unele specii. In anumite situații, ca de exemplu, la organismele imature sau în condițiile stresului sever produs de septicemii, traume sau de

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
antagonist killer Gena Bak este localizată 6p21.31 și are în componența sa șase exoni și o lungime de aproximativ 2200 perechi de nucleotide. Proteina BAK are o greutate moleculară de aproximativ 23 400 Daltoni și este alcătuită din 211 aminoacizi. Ea este localizată pe fața internă a membranei mitocondriale, unde este menținută în stare inactivă prin heterodimerizare cu MCL1 (membru antiapoptotic al familiei BCL-2) (Cuconati și colab., 2003). În absența MCL1, BAK oligomerizează, permeabilizează membrana mitocondrială și permite eliberarea citocromului

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
normale și casp-9 gamma, care rezultă în urma splicing-ului alternativ al exonului patru al caspazei-9 normale și care are o inserție de 58 nucleotide. Segmentul inserat în casp-9 gamma introduce un codon stop prematur care determină apariția unei proteine de 154 aminoacizi corespunzătoare domeniului CARD al CASP-9 normale. CASP 9gamma nu conține subunitățile catalitice și nu poate promova apoptoza, dar asemănător caspazei beta poate inhiba apoptoza pe baza interacției dintre domeniile CARD ale caspazei și ale APAF-1 (Seol și colab., 1999; Srinivasula

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
baza interacției dintre domeniile CARD ale caspazei și ale APAF-1 (Seol și colab., 1999; Srinivasula și colab., 1999; Wang și colab., 2006). CASP-9 este sintetizată ca precursor PROCASP-9, care ulterior este convertit în forma activă. PROCASP-9 este alcătuită din 416 aminoacizi și are o greutate de 46281 Da. CASP-9 conține un prodomeniu (CARD), o subunitate catalitică mare LSCD-de la Large Subunit Catalytic Domain și o subunitate catalitică mică SSCD-de la Small Subunit Catalytic Domain. Casp-9 se exprimă ubicvitar. Nivelele de expresie

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
prima dată existența a două variante ale acestei caspaze și anume casp-3 (ARNm de 800 pb) și casp-3s (ARNm 700pb). Casp-3s este rezultatul unui proces de splicing alternativ al exonului șase care determină apariția unei variante mai scurte cu 95 aminoacizi, având aceeași succesiune de aminoacizi cu CASP-3 la capătul N-terminal (unde se găsește prodomeniul) și conținând cea mai mare parte a subunităților mari (Huang și colab., 2001). În gena casp-3 s-a dovedit că există mai multe polimorfisme care

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
variante ale acestei caspaze și anume casp-3 (ARNm de 800 pb) și casp-3s (ARNm 700pb). Casp-3s este rezultatul unui proces de splicing alternativ al exonului șase care determină apariția unei variante mai scurte cu 95 aminoacizi, având aceeași succesiune de aminoacizi cu CASP-3 la capătul N-terminal (unde se găsește prodomeniul) și conținând cea mai mare parte a subunităților mari (Huang și colab., 2001). În gena casp-3 s-a dovedit că există mai multe polimorfisme care sunt asociate cu cancerul pulmonar

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
un risc mult mai scăzut de a face cancer pulmonar (Jang și colab., 2007). P53 -de la Protein 53 kDa)/TP53 de la Tumor protein p53 Gena tp53 localizată 17p13 are unsprezece exoni dintre care primul necodificator. Proteina P53 are 393 aminoacizi și o structură multidomenică: un domeniu de transactivare (1-42), un domeniu bogat în prolină (63-97), un domeniu de atașare specifică la ADN (102-292), trei semnale de localizare nucleară (325-355) și un domeniu de reglare negativă (360-393). Domeniile proteinice sunt înalt

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
120 A), CD 95 (FAS sau APO1), TRAIL (de la tumor related apoptosis-inducing ligand receptor) DR-4 și DR-5. FAS, TNFR1 și TRAIL-R/DR4 sunt capabili de a transduce un semnal apoptotic și au în comun o regiune citoplasmatică de aproximativ 80 aminoacizi, cunoscută ca domeniul morții. Mutația survenită în această zonă la nivelul FAS și TNFR1 reprimă capacitatea lor de a iniția apoptoza și de aceea este considerată a fi răspunzătoare pentru transducția semnalului apoptotic. Moleculele adaptoare precum FADD sau TRADD posedă

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
1985 de către Old. Ea are localizarea 6p21.3 și o lungime de aproximativ 3 kb, conținând patru exoni. Ultimul exon codifică pentru mai mult de 80% din proteina secretată (Nedwin și colab., 1985). Proteinele TNF au 17kDa și conțin 185 aminoacizi. TNF este o proteină transmembranară de tip II și conține 212 aminoacizi, iar citokina homotrimerică solubilă (STNF) care rezultă în urma clivării proteolitice are 51kDa. TNF are două forme, α și β, acestea având o structură identică în proporție de 28

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
aproximativ 3 kb, conținând patru exoni. Ultimul exon codifică pentru mai mult de 80% din proteina secretată (Nedwin și colab., 1985). Proteinele TNF au 17kDa și conțin 185 aminoacizi. TNF este o proteină transmembranară de tip II și conține 212 aminoacizi, iar citokina homotrimerică solubilă (STNF) care rezultă în urma clivării proteolitice are 51kDa. TNF are două forme, α și β, acestea având o structură identică în proporție de 28% și sunt codificate de două gene diferite. În activarea receptorilor TNF de

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
selectarea inhibitorului FLIP al caspazei-8 competitive sau, în absența lui FLIP, asamblează FADD și caspaza-8 într-un complex pentru semnalizarea apoptozei. 30.2.2. FAS (APO-1 SAU CD95) Receptorul FAS este o glicoproteină transmembranară de 48 kDa, formată din 319 aminoacizi. Ea aparține familiei de receptori TNF. Capătul său amino-terminal este intracitoplasmatic, iar cel carboxi-terminal este extracitoplasmatic. FAS este codificat de o genă localizată 10q24.1, care are nouă exoni: exonii unu→ cinci codifică pentru regiunea extracelulară, exonul șase pentru zona

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
este codificat de o genă localizată 10q24.1, care are nouă exoni: exonii unu→ cinci codifică pentru regiunea extracelulară, exonul șase pentru zona transmembranară, iar exonii șapte → nouă codifică pentru regiunea intracelulară (Goldsby și colab., 2003). Domeniul extracelular conține 157 aminoacizi și este bogat în resturi de cisteină, domeniul transmembranar este alcătuit din 17 aminoacizi, iar cel citoplasmatic - din 145 aminoacizi (Huang și colab., 1996). Gena Fas este al șaselea membru al familiei Tnf și de aceea a fost denumită gena

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
cinci codifică pentru regiunea extracelulară, exonul șase pentru zona transmembranară, iar exonii șapte → nouă codifică pentru regiunea intracelulară (Goldsby și colab., 2003). Domeniul extracelular conține 157 aminoacizi și este bogat în resturi de cisteină, domeniul transmembranar este alcătuit din 17 aminoacizi, iar cel citoplasmatic - din 145 aminoacizi (Huang și colab., 1996). Gena Fas este al șaselea membru al familiei Tnf și de aceea a fost denumită gena Tnfrsf 6. Gena are patru situsuri polimorfe în pozițiile: -1377, -670 (regiunea promotoare), +416

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
șase pentru zona transmembranară, iar exonii șapte → nouă codifică pentru regiunea intracelulară (Goldsby și colab., 2003). Domeniul extracelular conține 157 aminoacizi și este bogat în resturi de cisteină, domeniul transmembranar este alcătuit din 17 aminoacizi, iar cel citoplasmatic - din 145 aminoacizi (Huang și colab., 1996). Gena Fas este al șaselea membru al familiei Tnf și de aceea a fost denumită gena Tnfrsf 6. Gena are patru situsuri polimorfe în pozițiile: -1377, -670 (regiunea promotoare), +416 (exon trei) și +836 (exon șapte

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
apoptoza este isoforma-1, o proteină transmembranară de tipul I. Structura tridimensională a lui FAS prezintă regiuni α helicale antiparalele. Helixul 3 leagă domeniul morții FADD la începutul transducției semnalului (Fesik, 2000). Ligandul pentru FAS (FAS L) are un domeniu de aminoacizi hidrofili la mijloc și un segment carboxi-terminal la exterior. Regiunea extracelulară are 150 aminoacizi, fiind similară cu regiunile omoloage ale membrilor familiei TNF. La om și șoarece acest ligand este codificat de o genă de pe cromozomul unu, având cinci exoni

Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean (2006) [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]