245 matches
-
în genomul de mamifere, la situsul de integrare cromatina adoptă o conformație inactivă și asemenea secvențe nu sunt exprimate (Keshlet și colab., 1986). Metilarea in vitro a unor regiuni discrete ale secvenței genice înainte de realizarea transformării celulare a sugerat că metilarea unor situsuri specifice este adesea suficientă spre a bloca expresia genică (Yisraeli și colab., 1988). Genomul multor specii de plante prezintă metilare atât la nivelul dinucleotidului CpG, cât și la nivelul trinucleotidului CpNpG în care N poate fi A, C
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
1986). Metilarea in vitro a unor regiuni discrete ale secvenței genice înainte de realizarea transformării celulare a sugerat că metilarea unor situsuri specifice este adesea suficientă spre a bloca expresia genică (Yisraeli și colab., 1988). Genomul multor specii de plante prezintă metilare atât la nivelul dinucleotidului CpG, cât și la nivelul trinucleotidului CpNpG în care N poate fi A, C sau T și peste 30% dintre resturile C pot fi metilate la anumite specii (Gruenbaum și colab., 1981). Nivelul metilării genelor din
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
plante prezintă metilare atât la nivelul dinucleotidului CpG, cât și la nivelul trinucleotidului CpNpG în care N poate fi A, C sau T și peste 30% dintre resturile C pot fi metilate la anumite specii (Gruenbaum și colab., 1981). Nivelul metilării genelor din T-ADN din celulele cancerului de colet și din elementele transpozabile și genele proteinelor de rezervă se corelează invers cu expresia genică. Genele neexprimate din T-ADN pot fi activate prin tratamentul celulelor transformate cu 5-azacitidină. La porumb
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
genelor din T-ADN din celulele cancerului de colet și din elementele transpozabile și genele proteinelor de rezervă se corelează invers cu expresia genică. Genele neexprimate din T-ADN pot fi activate prin tratamentul celulelor transformate cu 5-azacitidină. La porumb, metilarea ADN reduce afinitatea unei proteine de legare la ADN, față de situsul țintă al acesteia. John și Amasino (1989) au realizat analiza schimbărilor în metilarea ADN legate de schimbările în expresia genică a T-ADN în celulele cancerului de colet. Acest
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
Genele neexprimate din T-ADN pot fi activate prin tratamentul celulelor transformate cu 5-azacitidină. La porumb, metilarea ADN reduce afinitatea unei proteine de legare la ADN, față de situsul țintă al acesteia. John și Amasino (1989) au realizat analiza schimbărilor în metilarea ADN legate de schimbările în expresia genică a T-ADN în celulele cancerului de colet. Acest T-ADN conține bacteriooncogene derivate din oncogene vegetale care codifică sinteza unor enzime implicate în biosinteza factorilor de creștere la plante (Weiler și Schroder
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
de nucleotide era hipermetilată, autorii au izolat o linie celulară în cadrul căreia au obținut revertanți în care expresia genică a fost reactivată, fie spontan, fie în urma tratamentului cu 5-azacitidină. Această reactivare genică a fost însoțită de modificarea pattern-ului de metilare a genei ipt. Toți revertanții sunt extensiv demetilați în regiunea înconjurătoare a secvenței acestei gene, ceea ce a făcut ca autorii să tragă concluzia că demetilarea care însoțește reactivarea acestei gene nu prezintă specificitate detectabilă de situs în linia celulară investigată
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
supuse reversiei, autorii au estimat că frecvența de reversie este sub 10-6. Toți cei trei revertanți spontani CX2 1, 2 și 3 (CX2SR1, CX2SR2 și CX2SR3) au fost ulterior studiați (John și Amasino, 1989). S-a studiat pattern-ul de metilare la nivelul locusului ipt și ARNm ipt din liniile care au reinițiat spontan expresia T-ADN (CX1, CX2SR1, CX2SR2 și CX2SR3), din două linii în care reexpresia a apărut în urma tratamentului cu 5-azacitidină desemnate CX2AR1 și CX2AR2 și dintr-o
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
fitohormon și este totdeauna asociată cu fenotipul tumoral. În plus, ambele căi ale reversiei (spontană și indusă de 5-azacitidină) au condiționat realizarea unui nivel similar de expresie a oncogenei ipt. Autorii au realizat și un studiu comparativ al pattern-ului metilării ADN de la nivelul secvenței genei ipt cu acela la nivelul regiunilor flancatoare din linia care a conținut un insert T-ADN silențiat (CX2) cu acela întâlnit în liniile care au exprimat ipt, fie spontan, fie sub acțiunea 5-azacitidinei. În cadrul acestui
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
ipt, fie spontan, fie sub acțiunea 5-azacitidinei. În cadrul acestui studiu, ADN a fost clivat cu endonucleaza de restricție BamHI care taie regiunea ipt în două fragmente (fig. 33.11). Fragmentele obținute au fost ulterior supuse digestiei cu enzimele sensibile la metilare Dde I, Hha I, Hpa II, Msp I sau Pst I. Probele restricționate au fost fracționate dimensional prin electroforeză în gel de agaroză după care au fost transferate pe membrane de nylon (blotting) și hibridizate cu probe radioactive complementare cu
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
prin electroforeză în gel de agaroză după care au fost transferate pe membrane de nylon (blotting) și hibridizate cu probe radioactive complementare cu regiunile 5’ (proba 1) și 3’ (proba 2) ale locusului ipt. Situsurile la care enzimele sensibile la metilare au clivat ADN în cadrul fragmentelor BamHI au fost decelate după pattern-ul restrictelor de greutate moleculară redusă care au hibridizat cu probele utilizate. Clivarea la nivelul unuia dintre aceste situsuri de către enzima sensibilă la metilare demonstrează că situsul respectiv nu
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
la care enzimele sensibile la metilare au clivat ADN în cadrul fragmentelor BamHI au fost decelate după pattern-ul restrictelor de greutate moleculară redusă care au hibridizat cu probele utilizate. Clivarea la nivelul unuia dintre aceste situsuri de către enzima sensibilă la metilare demonstrează că situsul respectiv nu conține un rest de citozină metilată, la o poziție inhibitorie pentru enzimă. Rezistența la clivare la un anumit situs este un indiciu că acolo ADN este modificat și clivarea este blocată, după toate probabilitățile, datorită
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
demonstrează că situsul respectiv nu conține un rest de citozină metilată, la o poziție inhibitorie pentru enzimă. Rezistența la clivare la un anumit situs este un indiciu că acolo ADN este modificat și clivarea este blocată, după toate probabilitățile, datorită metilării. Enzimele de restricție isoschizomere Msp I și Hpa II recunosc un singur situs comun în regiunea secvenței genice ipt. În ADN din linia CX2, fragmentul de restricție BamHI de 980 perechi de nucleotide a rămas intact după clivare cu cele
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
primul situs Msp I din aval de regiunea codificatoare a rămas demetilat în toate liniile exprimate, cu excepția liniei CX2AR2 în care aceste situsuri din aval au fost parțial metilate. S-a evidențiat existența unui contrast evident între pattern-ul de metilare a ADN la nivelul locusului ipt din linia CX2 și acela identificat în liniile care au exprimat această genă. În linia CX2, secvența ipt a fost metilată la nivelul oricărui situs analizat. Totuși, în revertanții spontani sau induși cu 5-azacitidină
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de oncogenetică și oncogenomică. Partea II by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91988_a_92483]
-
de către histamină, metil-histamină și dimetil-histamină este antagonizată de tioperamină. Având localizare pre-sinaptică, receptorii H3 permit histaminei să participe la controlul propriei sale eliberări de la nivelul fibrelor histaminergice. Inactivarea histaminei se realizează în două etape. Într-un prim moment are loc metilarea acesteia de către enzima N-metil-transferază, utilizând radicalul metil al S-adenozilmetioninei. Metilhistamina rezultată este supusă apoi dezaminării oxidative și transformată în acid metilimidazolacetic. O altă cale de inactivare este reprezentată de participarea histaminazei la inactivarea histaminei în acid imidazolacetic urinar. Căile metabolice
Sistemul nervos vegetativ Anatomie, fiziologie, fiziopatologie by I. HAULICĂ () [Corola-publishinghouse/Science/100988_a_102280]
-
și de modulator al activității și metabolismului cerebral. Activarea adenilatciclazei de către histamină a fost observată în hipocamp, hipotalamus și neocortex. Unele antidepresante par să acționeze prin blocarea adenilatciclazei sensibile la histamină. Inactivarea histaminei endogene și exogene se realizează fie prin metilare, cu ajutorul imidazol N-metil transferazei prezente în cantități mari în mucoasa gastrică, fie prin dezaminare oxidativă, de către histaminaza (diaminoxidaza) tisulară sau plasmatică. Aceasta din urmă este crescută în cursul sarcinii. II.8.1.2. Serotonina Enteramina sau 5-hidroxitriptamina, îndeplinește - ca
Sistemul nervos vegetativ Anatomie, fiziologie, fiziopatologie by I. HAULICĂ () [Corola-publishinghouse/Science/100988_a_102280]
-
printr-o succesiune de fosforilări rezultă un fenotip proliferativ într-o varietate de sisteme celulare [19]. Activarea aberantă a căii RAS în CHC poate să apară prin intervenția unor variate mecanisme: supraexpresia H-RAS, anomalii ale numărului de copii ale ADN, metilarea aberantă a regiunii promotoare a unor gene cu rol important etc. Mutațiile punctiforme ale genei RAS apar atât în tumorile ce survin în mod natural, cât și în cele induse experimental, ducând la substituții ale aminoacizilor din codonul 12 (N-
Tratat de oncologie digestivă vol. II. Cancerul ficatului, căilor biliare și pancreasului by Luminița Leluțiu, Alexandru Irimie () [Corola-publishinghouse/Science/92126_a_92621]
-
și de inhibare a dezvoltării tumorale care ar putea fi utilizat în viitor ca posibilă țintă în terapia cancerului uman [38]. GENELE SUPRESOARE TUMORALE Inactivarea genelor supresoare tumorale poate fi realizată prin mutații, pierderea heterozigozității (LOH), pierderi bialelice sau prin metilarea regiunii promotoare (mecanism epigenetic). Gena TP53 Gena TP53 este localizată pe brațul scurt al cromozomului 17 (17p13.1) și conține o regiune centrală ,,core” sau domeniul de legare la ADN cu rol în activarea transcripției, fiind o zonă țintă pentru
Tratat de oncologie digestivă vol. II. Cancerul ficatului, căilor biliare și pancreasului by Luminița Leluțiu, Alexandru Irimie () [Corola-publishinghouse/Science/92126_a_92621]
-
eveniment tardiv în hepatocarcinogeneză. Inițial s-a considerat că în CHC inactivarea CDKN2A este produsă prin deleții homozigote și mutații, însă studiile realizate au arătat că inactivarea genei, care apare în stadiile timpurii ale hepatocarcinogenezei, se realizează în special prin metilarea excesivă a insulelor 5’CpG din regiunea promotoare (exonul 1) și nu este un eveniment specific CHC indus de VHC, aceeași frecvență a hipermetilării regiunii promotoare a genei fiind întâlnită și în cazurile de CHC nonVHC [58]. Inactivarea epigenetică a
Tratat de oncologie digestivă vol. II. Cancerul ficatului, căilor biliare și pancreasului by Luminița Leluțiu, Alexandru Irimie () [Corola-publishinghouse/Science/92126_a_92621]
-
tumorală în liniile celulare de CHC, între cele două evenimente genetice fiind descrisă o relație de reciprocitate [59]. În cazul CHC induse prin expunerea la AFB1, concentrația de AFB1 a fost găsită corelată cu rata mutațiilor TP53 și cu statusul metilării genei CDKN2A/p16 [60]. Proteina p21 CIP1/WAF1 un inhibitor Cdk (Cdk2, Cdk4), este codificată de o genă supresoare WAF1/CIP1 tumorală localizată pe cromozomul 6p21.2. P21 blochează activitatea complexului Cdk2:Ciclina E și determină arestul mediat prin p53
Tratat de oncologie digestivă vol. II. Cancerul ficatului, căilor biliare și pancreasului by Luminița Leluțiu, Alexandru Irimie () [Corola-publishinghouse/Science/92126_a_92621]
-
caracterul invaziv și metastazant al celulelor tumorale, fiind un eveniment care apare în stadiile incipiente ale hepatocarcinogenezei [62]. Expresia scăzută a p27 a fost descrisă și la pacienții cu ciroză, iar pierderea expresiei p27 este rezultatul unui nivel crescut de metilare la nivelul regiunii promotoare a genei. Inactivarea funcțională prin hipermetilarea genei p27 a fost găsită asociată cu metilarea genei p16 [63]. CDH1 Gena CDH1 localizată pe cromozomul 16q22.1 codifică proteina numită E-caderină, o glicoproteină de adeziune celulară calciu dependentă
Tratat de oncologie digestivă vol. II. Cancerul ficatului, căilor biliare și pancreasului by Luminița Leluțiu, Alexandru Irimie () [Corola-publishinghouse/Science/92126_a_92621]
-
Expresia scăzută a p27 a fost descrisă și la pacienții cu ciroză, iar pierderea expresiei p27 este rezultatul unui nivel crescut de metilare la nivelul regiunii promotoare a genei. Inactivarea funcțională prin hipermetilarea genei p27 a fost găsită asociată cu metilarea genei p16 [63]. CDH1 Gena CDH1 localizată pe cromozomul 16q22.1 codifică proteina numită E-caderină, o glicoproteină de adeziune celulară calciu dependentă, cu rol în menținerea integrității structurale a țesutului epitelial. Pierderea funcției genei CDH1 contribuie la progresia cancerului prin
Tratat de oncologie digestivă vol. II. Cancerul ficatului, căilor biliare și pancreasului by Luminița Leluțiu, Alexandru Irimie () [Corola-publishinghouse/Science/92126_a_92621]
-
β-cateninei. Pierderea funcției proteinei APC prin represia transcripțională datorată hipermetilării regiunii promotoare a genei, prin mutații punctiforme sau prin LOH, împiedică degradarea β-cateninei care interacționează cu factorii de transcripție nucleari LEF/TCF și promovează intrarea celulelor în ciclul celular. Statusul metilării genei APC în CHC non-viral a fost găsit mai mic decât în CHC asociat infecției VHC [69]. Studii recente au arătat că în tipul nodular de CHC inactivarea genei APC a fost realizată prin mutații bialelice și nonsens la nivelul
Tratat de oncologie digestivă vol. II. Cancerul ficatului, căilor biliare și pancreasului by Luminița Leluțiu, Alexandru Irimie () [Corola-publishinghouse/Science/92126_a_92621]
-
prin splicing-ul alternativ, iar gena este frecvent inactivată în cancerul uman. Spre deosebire de o altă genă supresoare tumorală TP53, a cărei inactivare este realizată frecvent prin mutații, în cazul RASSF1A pierderea funcției se realizează prin hipermetilarea regiunii promotoare. Inactivarea RASSF1A prin metilarea aberantă a regiunii promotoare a fost raportată în CHC cu o frecvență de 70% atât la nivelul țesutului tumoral, cât și în plasma pacienților. În câteva studii a fost descrisă o asociere între frecvențele crescute ale hipermetilării regiunilor promotoare ale
Tratat de oncologie digestivă vol. II. Cancerul ficatului, căilor biliare și pancreasului by Luminița Leluțiu, Alexandru Irimie () [Corola-publishinghouse/Science/92126_a_92621]
-
regiunilor promotoare ale genelor RASSF1A și p16/INK4A și nivelul aducților ADN care apar în contaminarea cu AFB1. O hipermetilare intensă a promotorului RASSF1A a fost găsită în CHC asociate infecției cu VHB [73]. Cercetări recente au propus ca nivelul metilării RASSF1A să fie utilizat ca marker diagnostic pentru CHC, iar fenotipul metilator al insulelor CpG (CIMP) ca marker molecular pentru stadiile tardive ale hepatocarcinogenezei [74, 75]. PTEN Gena PTEN (phosphatase and tensin homolog) este situată pe cromozomul 10q23.3 și
Tratat de oncologie digestivă vol. II. Cancerul ficatului, căilor biliare și pancreasului by Luminița Leluțiu, Alexandru Irimie () [Corola-publishinghouse/Science/92126_a_92621]
-
creier, prostată și rinichi), sugerând implicarea acestei gene atât în tumorigeneză, cât și în progresia tumorală [76]. În CHC inactivarea genei PTEN a fost realizată cel puțin parțial prin mutații missens în exonii 5 (K144I) și 7 (V255A) sau prin metilarea aberantă a regiunii promotoare, pierderea funcției PTEN fiind asociată cu progresia tumorală și cu un prognostic nefavorabil [77]. INSTABILITATEA GENOMICĂ În majoritatea tumorilor instabilitatea genomică se manifestă printr-o deficiență a sistemului MMR sau prin instabilitate cromozomială. Instabilitatea microsateliților (MSI
Tratat de oncologie digestivă vol. II. Cancerul ficatului, căilor biliare și pancreasului by Luminița Leluțiu, Alexandru Irimie () [Corola-publishinghouse/Science/92126_a_92621]