17,554 matches
-
la nivelul fiecărui locus Ig. Există o anumită corelație între desfășurarea transcripției și inducerea mutațiilor, dar baza moleculară pentru mutația somatică nu este cunoscută. Mutația somatică are loc în cursul proliferării clonale aparent la o rată de aproximativ 10-3 per pereche de nucleotide, per generație celulară. Aproximativ jumătate dintre celulele rezultate dobândesc câte o mutație, astfel că celulele care exprimă anticorpi mutanți reprezintă o fracție mare a clonei din care fac parte. În multe cazuri, este utilizat în mod consistent o
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
deletat în cadrul rearanjamentului de segmente genice imunoglobulinice în limfocitele mature, transcripția genei imunoglobulinice este dramatic diminuată. Mai multe motive de secvență distinctive definesc promotorul bazal al unei gene imuno-globulinice și anume o secvență asemănătoare TATA, situată în sectorul de 20-30 perechi de nucleotide față de situsul start al transcripției. Această secvență este un octamer conservat (octa) 5’-ATGCAAAT-3’, localizat la aproximativ 30-60 perechi de baze depărtare, în amonte față de situsul de start al transcripției, și o secvență heptamerică consens (hepta) 5’-ATGCAAT-3
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
distinctive definesc promotorul bazal al unei gene imuno-globulinice și anume o secvență asemănătoare TATA, situată în sectorul de 20-30 perechi de nucleotide față de situsul start al transcripției. Această secvență este un octamer conservat (octa) 5’-ATGCAAAT-3’, localizat la aproximativ 30-60 perechi de baze depărtare, în amonte față de situsul de start al transcripției, și o secvență heptamerică consens (hepta) 5’-ATGCAAT-3’ situată la aproximativ 25 perechi de baze în amonte de octamer (fig. 4.3). Pentru transcripție și pentru specificitatea celulară, cel
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
start al transcripției. Această secvență este un octamer conservat (octa) 5’-ATGCAAAT-3’, localizat la aproximativ 30-60 perechi de baze depărtare, în amonte față de situsul de start al transcripției, și o secvență heptamerică consens (hepta) 5’-ATGCAAT-3’ situată la aproximativ 25 perechi de baze în amonte de octamer (fig. 4.3). Pentru transcripție și pentru specificitatea celulară, cel mai important motiv al promotorului bazal este secvența octamerică. Excizia acestui motiv compromite activitatea transcripțională a promotorului. Pe de altă parte, inserția unui segment
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
Ig pentru catena L(κ) se aseamănă promotorului CH, în ceea ce privește aranjamentul motivelor de tip TATA și octamer, numai că secvența octamer din promotorul IgL(κ) are orientare opusă. Toți promotorii genei IgL(κ) conțin un element pentadecanucleotidic la aproximativ 100 perechi de nucleotide. Secvențele de tip TATA și octamer sunt esențiale pentru transcripția genei IgL(κ), numai că rolul pentadecanucleotidului este neclar, deoarece eliminarea sa nu afectează transcripția. Transcripția optimă a genelor CH(κ) are la bază integritatea enhancerilor corespunzători lor
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
D și J este flancată de o secvență semnal de recombinare care definește situsul de rearanjare. Secvența semnal este reprezentată de un heptamer și un nonamer conservat, separate de un spacer neconservat de 12 și, respectiv, un spacer de 23 perechi de nucleotide. Rearanjarea are loc la granița dintre heptamer și regiunea codificatoare. Lungimea secvenței spacer definește două tipuri distincte de semnale de joncțiune și rearanjarea eficientă se face numai cu unul dintre aceste semnale de joncțiune. Rearanjarea normală produce o
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
deformări din ADN. S-a sugerat o corelație cu legarea la heptamer a acestei proteine, pe baza studiilor RMN, care au arătat că tripleta CAC/GTG prezintă o structură ADN neobișnuită cu o parțială anulare a forțelor de stocare a perechilor de baze azotate. Pentru moment, nu s-a putut stabili rolul precis al fiecărui factor de semnal-legare în rearanjarea V(D)J, mai ales pentru că au o distribuție largă, astfel încât dacă sunt implicați, specificitatea limfoidă a reacției de rearanjare genică
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
nespecifică a capetelor codificatoare, înainte de reunirea lor. Se pune problema dacă sinapsa celor două situsuri trebuie să preceadă clivajul. Sunt puține date despre acest aspect. După cum s-a descris, un set de rupturi dublu-catenare la TCRδ este realizat doar ca perechi. Pe de altă parte, joncțiunile deschis-și-lovit (open- and- shut joints) necesită probabil doar o singură secvență semnal, dar acestea sunt evenimente foarte rare. O problemă care trebuie descifrată este aceea referitoare la adițiile auto-complementare. S-a sugerat că o catenă
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
diferite cu același rezultat. Regiunile de macaz au lungime variabilă, fapt dovedit de limitele situsurilor implicate în recombinare, situate între 1 și 10 kb. Ele conțin grupe de scurte repetiții omoloage, cu unități repetitive, care variază între 20 și 80 perechi de nucleotide lungime. O regiune S are în mod tipic o localizare la aproximativ 2 kb în amonte de segmentul genic CH. Reacția de realizare a macazului eliberează materialul excizat dintre situsurile de macaz sub forma unei molecule circulare de
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
se prezintă detalii de organizare a genelor C4/CYP21 și DRB (Campbell și Trowsdale, 1993). Tipajul bazat pe secvențierea ADN a evidențiat un polimorfism corespunzător secvenței de nucleotide, la nivelul exonilor din gena DRB1 din cei doi cromozomi omologi ai perechii 6 (Marry și colab., 1997). Dintre aceste gene adiționale, doar gena HLA-G este exprimată tranzient și anume în trofoblaste fiind implicată probabil în asigurarea toleranței imune la interfața materno-fetală (Marry și colab., 1997). Unele dintre genele pentru antigenele CMH clasa
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
fi deduse din stabilirea haplotipurilor copiilor. Prin analiza părinților neînrudiți, se poate deduce frecvența alelelor singulare și prin aceasta se poate calcula valoarea ∆. Genele CMH purtate de unul sau de cel de al doilea dintre cei doi cromozomi omologi ai perechii 6, din garnitura diploidă de cromozomi umani, constituie haplotipul CMH. În sistemul HLA, ca, de altfel, și în cazul sistemului Rh, sunt frecvente devierile de la echilibru de linkage. Deosebirea dintre cele două sisteme sangvine este că în cazul sistemului sangvin
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
celulă T, este consecința excluziei alelice. Este un caz tipic de reglare prin feed-back negativ, deoarece un rearanjament funcțional reușit, pentru o alelă a unei catene grele situată într-un cromozom, supresează rearanjamentul pentru cealaltă alelă, din cromozomul omolog al perechii de cromozomi purtători ai segmentelor genice pentru catena grea Ig sau pentru TCR. Tot astfel, un rearanjament funcțional pentru oricare dintre alelele celor patru gene care dețin informația genetică pentru sinteza de catene ușoare Ig sau TCR supresează desfășurarea unui
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
din catene γ și δ, cu o secvență diferită de aminoacizi. Catenele α, β și δ au aproximativ 45 kDa, iar catena γ are 35 kDa. Diferențele de greutate moleculară exprimă nivele diferite de glicozilare. Cele două catene ale unei perechi sunt ținute împreună prin legături disulfidice. Ca și în cazul catenelor H și L ale anticorpilor, fiecare catenă a TCR prezintă o regiune variabilă N-terminală și o regiune constantă C- terminală, parțial ancorată în membrană. Specificitatea TCR de legare
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
și B5 codifică pentru catenele β HLA clasa II. Locii genici DRB3, DRB4 și DRB5 sunt trecuți în paranteză cu semnificația că nu toate complexele HLA conțin acești loci genici. Complexul HLA dintr-unul dintre cei doi cromozomi omologi ai perechii a 6-a formează un haplotip, astfel că fiecare individ uman are două haplotipuri HLA (Hurley, 1997). Produșii genici A, B și C se asociază cu produsul genei pentru β2-microglobulină, spre a forma moleculele CMH clasa I. Produșii locilor genici
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
alelic (ARMS), secvențierea ADN, polimorfism conformațional cu specificitate de secvență, tiparea heteroduplexului. Sensibilitatea și specificitatea procedurii de tipare HLA sunt substanțial ameliorate prin amplificarea regiunii ADN care deține genele HLA, utilizând tehnica PCR. În procesul de patentare se utilizează o pereche de oligonucleotide monocatenare sintetice (primeri) ce conțin secvențe complementare secvențelor care flanchează o anumită genă HLA, o ADN polimerază termostabilă (Taq1-polimeraza) într-un amestec de reacție care este desfășurată într- un termocycler și prin care se produc milioane de copii
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
utilizarea ei. O altă metodă de identificare a alelelor HLA este reprezentată de secvențierea directă a ADN al alelelor HLA purtate de un individ uman. Secvențierea este laborioasă și foarte complexă, dar este cea mai precisă în identificarea corectă a perechii HLA potrivită pentru realizarea unui transplant. Aceasta deoarece, secvențierea poate identifica toate diferențele prezente în regiunea analizată, pe când celelalte metode bazate pe analiza ADN pot scăpa polimorfismele de secvență care nu pot fi testate cu ajutorul primerilor și / sau al probelor
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
puține situsuri pentru endonucleazele de restricție. Genele VSG exprimate sunt totdeauna foarte apropiate de o telomeră. Invariabil, capătul 3’ al catenei sens este proximal față de telomeră. T. brucei are aproximativ 100 cromozomi, majoritatea foarte mici, cu mai puțin de 106 perechi de nucleotide. Genele VSG exprimate au fost identificate în cel puțin trei regiuni telomerice diferite, dar numărul real de loci telomerici, potențial activi, este necunoscut. Este clar că locația telomerică a genei VSG, pentru a fi exprimată, este o condiție
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
și silențierea genelor VSG, s-au evidențiat prin electroforeză în gel cu câmp pulsatoriu, precum și prin blotting ADN (fig. 15.3). Transpoziția duplicativă a unei copii a genei pentru VSG implică, alături de împerecherea dintre repetițiile în tandem lungi de 76 perechi de baze, de pe partea 5’ a secvenței genice și recombinarea omologă între capătul 3’ al unității transpozate și capătul 3’ al VSG pe care aceasta o înlocuiește. Datorită migrației catenei, punctul de cross-over al recombinării poate să apară, în principiu
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
moleculelor de ARNm și lungimea unităților de transcriere sunt neobișnuite. Secvența de la capătul 5’ al ARNm VSG este foarte diferită de secvența din regiunea omoloagă a ELC de pe care aceasta este transcrisă. În primul rând, gena exprimată începe cu 35 perechi de nucleotide netraduse. În al doilea rând, unele secvențe din ELC lipsesc. Aceeași lungime de 35 de nucleotide se întâlnește la startul tuturor moleculelor de ARNm pentru VSG ca și la startul celor mai multe, dacă nu al tuturor moleculelor de ARNm
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
al doilea rând, unele secvențe din ELC lipsesc. Aceeași lungime de 35 de nucleotide se întâlnește la startul tuturor moleculelor de ARNm pentru VSG ca și la startul celor mai multe, dacă nu al tuturor moleculelor de ARNm de la tripanosome. Cele 35 perechi de nucleotide sunt întâlnite în unitatea de 1,4 kilobaze, repetată de 200 de ori în genomul de Trypanosoma, dar nelincată cu genele VSG. Majoritatea acestor unități repetate se află în șiruri dispuse în tandem direct. Repetițiile sunt transcrise in
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
în apropierea capătului său 3’. Formarea ARNm funcțional pentru VSG implică joncțiunea med-RNA cu regiunea transcriptului primar ce conține mesajul pentru VSG. Cele două tipuri de ARN sunt unite printr-un transsplicing, care reunește direct transcriptul fragmentului exonic de 35 perechi de baze la transcriptul regiunii codificatoare pentru VSG. Din fracția poliadenilată a ARN de Trypanosoma, spre capul 3’ al med-RNA sunt eliminate 100 nucleotide sub acțiunea unei enzime de clivare, existentă în celula umană și acest lucru este dedus după
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
grupat în cromozomi, constituind clusteri genici (fig. 16.4). La specia umană, genele pentru catene de tip β (ε Gγ, Aγ, δ și β) sunt localizate în brațul scurt al cromozomului 11, pe o întindere de ADN de 60 000 perechi de baze (pb) adică 60 kilobaze (kb) din regiunea 1, banda 5, subbanda 5. O astfel de localizare a clusterului genic pentru β-globine este desemnată 11p 15.5. Există două gene γ desemnate γA și γG care se deosebesc numai
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
dintre gena pentru catena β și gena pentru catena γ este dovedit de existența hemoglobinei Kenya (Hb-γβ), care este consecința fuziunii parțiale a acestor două gene. Analiza moleculară a organizării acestor gene sugerează existența unei distanțe de câteva mii de perechi de nucleotide între genele γ și δ, pe de o parte, și între genele δ și β, pe de altă parte. Aranjamentul genic în complexul codificator este următorul: Gγ, Aγ, δ, β. Ordinea genelor pentru catenele globinice în cromozomi este
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
diferite ale ontogenezei sunt produse hemoglobine diferite, ca răspuns adaptativ la variația necesităților în oxigen ale țesuturilor organismului în cele trei stadii diferite de evoluție ontogenetică. Toate hemoglobinele umane normale au o aceeași structură de bază, fiind alcătuite din două perechi diferite de catene globinice, pliate într-o structură tridimensională complexă. Fiecare dintre cele patru catene globinice se asociază cu un grup hem atașat la suprafața catenei polipeptidice și reprezentând componenta care poartă oxigenul. Diferite catene globinice au fost notate cu
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]
-
de lungime variabilă. Această organizare a genelor globinelor este colineară cu diferențierea a trei domenii în catenele globinice (fig. 16.6). De la situsul CAP care reprezintă punctul start al transcripției genice, primul exon include o secvență netradusă de aproximativ 50 perechi de nucleotide, desemnată 5’UTR și codonii pentru primii 31 aminoacizi ai catenei α-globinice și primii 30 de aminoacizi ai catenei β-globinice. Cel de al doilea exon codifică pentru aminoacizii 32-99 ai catenei α- și aminoacizii 31-104 ai catenei β-globinice
Imunogenetică și oncogenetică. Principii de imunogenetică. Partea I by Lucian Gavrilă, Aurel Ardelean () [Corola-publishinghouse/Science/91987_a_92482]