8,529 matches
-
unor modificări apărute în solvent: redistribuirea electronilor în solvent, reorientarea moleculelor de solvent în jurul dipolilor stării excitate sau interacțiunea dintre fluorofori și solvent. Influența solventului asupra spectrelor de fluorescență se traduce în informații despre mișcarea moleculelor, localizarea fluoroforilor legați de molecula respectivă sau de membrane. Spectrele de emisie fluorescentă sunt influențate și de transferul de energie, pH, temperatură și diverși detergenți. Temperatura este unul dintre factorii care afectează foarte puternic structura spațială a proteinelor, prin procesul de denaturare a conformației spațiale
BIOFIZICA ȘI BIOENERGETICA SISTEMELOR VII by Claudia Gabriela Chilom () [Corola-publishinghouse/Science/1580_a_2899]
-
fundamentală; transferul energetic încrucișat (CIS), între starea singlet și starea triplet; transferul neradiativ de energie (conversia internă: CI), între stări singlet și între o stare singlet și una triplet. Fluorescența este un fenomen fizic, care are două faze distincte: excitarea moleculelor pe niveluri electronice superioare și emisia de radiație de către acestea, de pe primul nivel electronic singlet excitat pe nivelul fundamental. Cromoforii fluorescenți (denumiți și fluorofori) absorb fotoni, rămân în stare excitată câteva nanosecunde, după care emit, de regulă, fotoni de energie
BIOFIZICA ȘI BIOENERGETICA SISTEMELOR VII by Claudia Gabriela Chilom () [Corola-publishinghouse/Science/1580_a_2899]
-
și emisia de radiație de către acestea, de pe primul nivel electronic singlet excitat pe nivelul fundamental. Cromoforii fluorescenți (denumiți și fluorofori) absorb fotoni, rămân în stare excitată câteva nanosecunde, după care emit, de regulă, fotoni de energie mai mică. Foarte multe molecule de interes biologic prezintă fluorescență intrinsecă, datorată grupărilor de tip cromofor pe care le posedă. Fluorescența intrinsecă a proteinelor. Doar trei dintre aminoacizii din care se formează lanțurile proteinelor prezintă fluorescență intrinsecă: triptofanul (Trp), tirozina (Tyr) și fenilalanina (Phe). Pentru
BIOFIZICA ȘI BIOENERGETICA SISTEMELOR VII by Claudia Gabriela Chilom () [Corola-publishinghouse/Science/1580_a_2899]
-
sunt dizolvate. Acest fapt este posibil, deoarece atât fluorescența Trp, cât și cea a Tyr depind, după cum s-a amintit, de o multitudine de factori externi, precum temperatura, natura și proprietățile solventului, pH-ul soluției, prezența sau absența unor ioni/molecule în soluția de proteină sau acțiunea radiațiilor ionizante. Unul dintre factorii importanți care influențează fluorescența proteinelor este polaritatea solventului. Poziția maximului emisiei fluorescente, așa cum se obține din spectrul de emisie, este sensibilă la polaritatea mediului și la mobilitatea fluoroforului în
BIOFIZICA ȘI BIOENERGETICA SISTEMELOR VII by Claudia Gabriela Chilom () [Corola-publishinghouse/Science/1580_a_2899]
-
este polaritatea solventului. Poziția maximului emisiei fluorescente, așa cum se obține din spectrul de emisie, este sensibilă la polaritatea mediului și la mobilitatea fluoroforului în acest mediu. În general, starea excitată este mult mai polară decât cea fundamentală. În aceste condiții, moleculele excitate tind să interacționeze cu un solvent polar, ducând la alinierea dipolilor electrici ai solventului. Consecința acestei alinieri este reprezentată prin deplasarea spre lungimi de undă mai mari a maximului intensității relative de emisie (spre domeniul spectral roșu). Astfel, modificarea
BIOFIZICA ȘI BIOENERGETICA SISTEMELOR VII by Claudia Gabriela Chilom () [Corola-publishinghouse/Science/1580_a_2899]
-
structurale, fie prin reacții chimice, fie prin formarea de complecși. În aceste cazuri, trebuie să se țină cont de câteva aspecte, care trebuie să rămână, întotdeauna, valabile: fluorescența trebuie să fie măsurată numai pentru situl de legare a ligandului la molecula proteică; fluorescența depinde de condițiile de mediu; nu trebuie să fie afectate proprietățile macromoleculelor studiate. În studiul acizilor nucleici, marker-ii fluorofori utilizați sunt acridinele. În studiul proteinelor, fluoroforii extrinseci cei mai folosiți sunt: 1-anilinonaphthalene-8-sulfonate (ANS) și derivații săi, rodamina, fluoresceina
BIOFIZICA ȘI BIOENERGETICA SISTEMELOR VII by Claudia Gabriela Chilom () [Corola-publishinghouse/Science/1580_a_2899]
-
prezența stărilor molten globule din structura împachetată a proteinelor sau expunerea spre solvent a suprafețelor apolare din structura acestora. În urma examinării spectrelor fluoroforului. ANS și ale derivaților săi, s-a observat că, în medii nepolare, randamentul cuantic al fluorescenței acestor molecule crește semnificativ, iar spectrul se deplasează spre lungimi undă de emisie mai mici. Aceste efecte se manifestă și în solvenți cu polaritatea scăzută, comparativ cu aceia care au o polaritate semnificativă. Metoda Scatchard pentru determinarea constantei de legare. Pentru a
BIOFIZICA ȘI BIOENERGETICA SISTEMELOR VII by Claudia Gabriela Chilom () [Corola-publishinghouse/Science/1580_a_2899]
-
cu ajutorul căreia se poate calcula constanta de afinitate a unui ligand pentru o anumită proteină, numită ecuația Scatchard sau Rosenthal Scatchard, exprimă o dependență liniară între datele experimentale obținute în procesul de formare a complexului proteină ligand. Specificitatea ligandului pentru molecula proteică poate fi monitorizată, în condiții de echilibru, prin experimente de legare a ligandului la macromoleculă, până la saturația sitului/siturilor de legare a/ale macromoleculei, pentru ligandul respectiv. Din analiza datelor experimentale, se pot determina numărul de molecule de ligand
BIOFIZICA ȘI BIOENERGETICA SISTEMELOR VII by Claudia Gabriela Chilom () [Corola-publishinghouse/Science/1580_a_2899]
-
ligandului pentru molecula proteică poate fi monitorizată, în condiții de echilibru, prin experimente de legare a ligandului la macromoleculă, până la saturația sitului/siturilor de legare a/ale macromoleculei, pentru ligandul respectiv. Din analiza datelor experimentale, se pot determina numărul de molecule de ligand legate la o macromoleculă și afinitatea moleculei respective pentru acesta. Analiza Scatchard are la bază ipoteza că procesul de legare este la echilibru. Atingerea echilibrului poate dura de la câteva minute, la câteva ore, în funcție de ligand, proteină, temperatură și
BIOFIZICA ȘI BIOENERGETICA SISTEMELOR VII by Claudia Gabriela Chilom () [Corola-publishinghouse/Science/1580_a_2899]
-
de echilibru, prin experimente de legare a ligandului la macromoleculă, până la saturația sitului/siturilor de legare a/ale macromoleculei, pentru ligandul respectiv. Din analiza datelor experimentale, se pot determina numărul de molecule de ligand legate la o macromoleculă și afinitatea moleculei respective pentru acesta. Analiza Scatchard are la bază ipoteza că procesul de legare este la echilibru. Atingerea echilibrului poate dura de la câteva minute, la câteva ore, în funcție de ligand, proteină, temperatură și de alte condiții experimentale. Timpul necesar atingerii echilibrului va
BIOFIZICA ȘI BIOENERGETICA SISTEMELOR VII by Claudia Gabriela Chilom () [Corola-publishinghouse/Science/1580_a_2899]
-
în cazul în care ligandul este în concentrație foarte mică. Când se determină timpul de echilibrare, se folosește o concentrație mică de ligand (10 20 % din valoarea constantei de disociere a complexului). Reprezentarea liniară a ecuației Scatchard, care descrie legarea moleculă ligand, conduce la determinarea constantei Scatchard, k, dar și a stoechiometriei, n, prin determinarea intersecțiilor cu cele două axe. Intersecția dreptei cu ordonata se face la valoarea n/k, iar cea cu abscisa la valoarea lui n. Panta dreptei din
BIOFIZICA ȘI BIOENERGETICA SISTEMELOR VII by Claudia Gabriela Chilom () [Corola-publishinghouse/Science/1580_a_2899]
-
axe. Intersecția dreptei cu ordonata se face la valoarea n/k, iar cea cu abscisa la valoarea lui n. Panta dreptei din reprezentarea Scatchard este (- k-1). Există situații în care ecuația nu are o reprezentare liniară, siturile de legare ale moleculei pentru ligand nefiind identice și independente. În acest caz, ecuația Scatchard se va scrie sub forma relației 1. Prepararea probelor Soluția tampon: Procesul de denaturare termică a proteinei, albumina serică umană (HSA) va fi studiat prin dizolvarea proteinei în soluția
BIOFIZICA ȘI BIOENERGETICA SISTEMELOR VII by Claudia Gabriela Chilom () [Corola-publishinghouse/Science/1580_a_2899]
-
exemplu - rezultă prin simpla extrapolare a puterii selecției de a crea proiectul bun al organismelor? Oare forța care face un ochi funcțional explică de asemenea de ce lumea adăpostește mii de specii de fluturi? Sau de ce multe nucleotide - grupurile legate de molecule ce formează ADN și ARN - în ființe multicelulare nu codează orice enzimă sau proteină implicată în construcția unui organism? Sau de ce dinozaurii dominanți au murit și mamiferele subordonate au supraviețuit pentru a prospera și, pe o traiectorie straniu contingentă, au
Darwin şi după Darwin: studii de filozofie a biologiei by Mircea Flonta () [Corola-publishinghouse/Science/1366_a_2708]
-
determinat schimbarea acestui program. Este o orientare a cercetării care distinge biologia evoluției de ceea ce Mayr numește „biologia funcției“. Distincția va fi fixată de Mayr prin dihotomia explicații prin cauze nemijlocite-explicații prin cauze mijlocite. De exemplu, cercetarea funcției unei anumite molecule și a relațiilor ei cu alte molecule din organism urmărește să identifice cauze nemijlocite, în timp ce răspunsul la întrebarea de ce se deosebesc moleculele din unele organisme de moleculele din alte organisme va fi dat cu referire la cauze mijlocite. Explicația comportării
Darwin şi după Darwin: studii de filozofie a biologiei by Mircea Flonta () [Corola-publishinghouse/Science/1366_a_2708]
-
a cercetării care distinge biologia evoluției de ceea ce Mayr numește „biologia funcției“. Distincția va fi fixată de Mayr prin dihotomia explicații prin cauze nemijlocite-explicații prin cauze mijlocite. De exemplu, cercetarea funcției unei anumite molecule și a relațiilor ei cu alte molecule din organism urmărește să identifice cauze nemijlocite, în timp ce răspunsul la întrebarea de ce se deosebesc moleculele din unele organisme de moleculele din alte organisme va fi dat cu referire la cauze mijlocite. Explicația comportării caracteristice indivizilor unei specii prin raportare la
Darwin şi după Darwin: studii de filozofie a biologiei by Mircea Flonta () [Corola-publishinghouse/Science/1366_a_2708]
-
fixată de Mayr prin dihotomia explicații prin cauze nemijlocite-explicații prin cauze mijlocite. De exemplu, cercetarea funcției unei anumite molecule și a relațiilor ei cu alte molecule din organism urmărește să identifice cauze nemijlocite, în timp ce răspunsul la întrebarea de ce se deosebesc moleculele din unele organisme de moleculele din alte organisme va fi dat cu referire la cauze mijlocite. Explicația comportării caracteristice indivizilor unei specii prin raportare la anumite corelații neurofiziologice este o explicație prin cauze nemijlocite. Dimpotrivă, explicația caracteristicilor comportamentale ale anumitor
Darwin şi după Darwin: studii de filozofie a biologiei by Mircea Flonta () [Corola-publishinghouse/Science/1366_a_2708]
-
explicații prin cauze nemijlocite-explicații prin cauze mijlocite. De exemplu, cercetarea funcției unei anumite molecule și a relațiilor ei cu alte molecule din organism urmărește să identifice cauze nemijlocite, în timp ce răspunsul la întrebarea de ce se deosebesc moleculele din unele organisme de moleculele din alte organisme va fi dat cu referire la cauze mijlocite. Explicația comportării caracteristice indivizilor unei specii prin raportare la anumite corelații neurofiziologice este o explicație prin cauze nemijlocite. Dimpotrivă, explicația caracteristicilor comportamentale ale anumitor specii și varietăți prin mutații
Darwin şi după Darwin: studii de filozofie a biologiei by Mircea Flonta () [Corola-publishinghouse/Science/1366_a_2708]
-
morți, pe care nu încetează a o combate, fără a o înlătura vreodată. Într-un anumit fel, ea integrează în sine și chiar profită de această moarte, care îi permite să reîntinerească pe măsură ce îmbătrînește, de vreme ce orice celulă își regenerează mereu moleculele care se degradează, orice organism își regenerează mereu celulele care mor, fiecare specie regenerează indivizi muritori. "A trăi din Moarte, a muri din Viață", spunea Heraclit, un mesaj asupra căruia nu am meditat îndeajuns. Prezența paloșului exterminator asupra capetelor noastre
Gîndind Europa by Edgar Morin () [Corola-publishinghouse/Science/1421_a_2663]
-
s-au desprins de perete și s-au pus în mișcare. Ei mișună în toate direcțiile în spațiu, ca, de exemplu, un roi de țânțari în încăperea în care sunt închiși sau, dacă preferați o comparație mai savantă, ca niște molecule gazoase în teoria cinetică a gazelor. Coliziunea lor reciprocă poate produce atunci noi combinații. Care va fi rolul efortului conștient prealabil? Evident, acela de a mobiliza câțiva dintre acești atomi, de a-i desprinde de perete și de a-i
Matematica și cunoașterea științifică by Viorel Barbu () [Corola-publishinghouse/Science/1112_a_2620]
-
Se consideră însă că și în acest teritoriu manifestările acestora sunt comune proceselor ateromatoase în genera. Explorarea disfuncției endoteliale de exemplu se face în prezent prin studierea unor markeri plasmatici (factorul van Willebrand, trombomodulina, sICAM și sVCAM - formele solubile ale moleculelor de adeziune intercelulară și a moleculelor de adeziune a celulelor vasculare - și E selectina) și a răspunsului vasodilatator la stimuli farmacologici 58. În condițiile practicii curente, aceste explorări sunt puțin disponibile iar analiza altor markeri este mai ușor de efectuat
Factorul de risc geometric în arteriopatiile obliterante aterosclerotice by Antoniu Octavian Petriş () [Corola-publishinghouse/Science/1161_a_2068]
-
acest teritoriu manifestările acestora sunt comune proceselor ateromatoase în genera. Explorarea disfuncției endoteliale de exemplu se face în prezent prin studierea unor markeri plasmatici (factorul van Willebrand, trombomodulina, sICAM și sVCAM - formele solubile ale moleculelor de adeziune intercelulară și a moleculelor de adeziune a celulelor vasculare - și E selectina) și a răspunsului vasodilatator la stimuli farmacologici 58. În condițiile practicii curente, aceste explorări sunt puțin disponibile iar analiza altor markeri este mai ușor de efectuat. Există însă serioase dubii în legătură cu răspunsul
Factorul de risc geometric în arteriopatiile obliterante aterosclerotice by Antoniu Octavian Petriş () [Corola-publishinghouse/Science/1161_a_2068]
-
mediul științific și academic, descoperirea presupune observarea unui nou fenomen, noi acțiuni sau noi evenimente și oferirea unor noi perspective pentru a integra noile cunoștințe obținute prin observație în sistemul teoretic deja existent. Găsirea adrenalinei de către John Jacob Abel, a moleculei ADN și a inelului din jurul planetei Saturn sunt exemple de descoperiri. Ceea ce este semnificativ pentru o descoperire este faptul că noile informații descoperite vor fi împărtășite întregii lumi. Spre deosebire de descoperire, invenția este o nouă compoziție, un instrument sau un proces
Societatea românească azi by Constantin Crăiţoiu [Corola-publishinghouse/Science/1063_a_2571]
-
teoria relativității, ce a revoluționat complet domeniul fizicii. 29 Omul de știință Friedrich August Kekule a văzut un șarpe încolăcindu-se și mișcându-și coada. Acesta a fost pentru el un indiciu în elaborarea structurii în formă de inel a moleculei de benzen, o decoperire foarte importantă a secolului nostru. Probabil în viață îți va veni în minte o idee sau o imagine care combină și sintetizează cîțiva factori. Rezultatul poate fi o nouă idee de afaceri, precum a avut Ray
Învăţarea eficientă - condiţie a reuşitei şcolare by Nicoleta Prepeliţă, Virginia Arghiropol () [Corola-publishinghouse/Science/1241_a_2217]
-
solvit prin porii membranei celulare depinde de dimensiunile acestora, de încărcarea lor electrică și de proprietătile membranei. Cel mai ușor trec substanțele liposolubile, deoarece membrana celulară are o structură lipoproteică. Difuziunea facilitată presupune intervenția unui transportor (o proteină ce leagă molecula de solvit și o trece de partea cealaltă a membranei, tot în sensul gradientului de concentrație). Efectul Donnan se manifestă prin menținerea unui echilibru între anioni și cationi de o parte și de alta a unei membrane biologice, de exemplu
Fiziologie - metabolism şi motricitate by Bogdan Alexandru HAGIU () [Corola-publishinghouse/Science/1171_a_1934]
-
sisteme de membrană este acel transfer cu consum energetic împotriva gradientului de concentrație prin membrane unor cellule care formează epitelii (de exemplu epiteliile intestinal și renal). Transportul transmembranar al macromoleculelor cuprinde mecanisme care realizează trecerea prin membrana celulară a unor molecule ce au dimensiuni mai mari decât porii membranari. Aceste mecanisme sunt: Fagocitoza, proces caracteristic leucocitelor, constă în înglobarea intracelulară într-o veziculă numită fagozom a microbilor sau fragmentelor celulare, urmată de distrugerea acestora cu ajutorul enzimelor lizozomale Pinocitoza este asemănătoare fagocitozei
Fiziologie - metabolism şi motricitate by Bogdan Alexandru HAGIU () [Corola-publishinghouse/Science/1171_a_1934]